本实用新型公开了一种氢气加气站的加氢系统，包括：用于接收氢气的输入单元；与输入单元连接的调节计量单元，对氢气的流量进行调整及计量；与调节计量单元连接的旁通单元，对来自于调节计量单元的氢气进行冷却；与调节计量单元和旁通单元连接的切断单元；与切断单元连接的加气单元，将来自切断单元的氢气注入到氢气受注装置中；检测氢气压力的第一检测单元，该第一检测单元与输入单元连接；检测氢气压力和温度的第二检测单元，该第二检测单元与切断单元或加气单元连接；控制器，该控制器分别与输入单元、调节计量单元、旁通单元、第一检测单元和第二检测单元连接。本实用新型具有提高氢气加气站的加氢系统安全性的优点。