本发明属于酶工程技术领域，公开了一种具有产壳四糖能力的壳聚糖酶突变体及其应用。将来源于枯草芽孢杆菌的GH46家族糖苷水解酶壳聚糖酶（BsCsn46A），氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示，对BsCsn46A第203位氨基酸残基进行饱和突变筛选出具有产壳四糖潜力的突变体，获得的壳聚糖酶突变体为E203M，E203S，E203R，E203H，E203N，E203C，E203Q，E203G，E203T，E203V，E203P。通过水解结果分析，获得的突变体具有产壳四糖的能力。