本发明提供了一种TBM隧道工程施工的全工序同步施工方法及系统，应用于土木工程道路工程技术领域。所述方法包括控制TBM机身对隧道进行掘进；在运输车卸料后，控制所述TBM机身后的后配套拖车旋转平台将运输车进行掉头；在TBM掘进中断时，控制设置在所述TBM机身两侧的应急模筑装置形成紧急支护结构；在所述TBM机身对隧道进行掘进时，控制超长越野皮带机将洞内的洞渣运输到洞室外；在所述TBM机身对隧道进行掘进后，控制设置在所述TBM机身后的衬砌智能工装对隧道的洞壁进行衬砌施工。以此方式，提升了工程整体施工效率，实现了TBM智能运输全工序同步。