本发明公开了一种基于作业指标预测的花生脱壳难度预测方法及系统，其中方法包括：获取第一数据集，第一数据集包括花生品种、基础特性以及实测作业指标；基于基础特性数据进行统计，得到第二数据集；基于第二数据集对各基础特性与破损率及脱净率进行相关性分析，以得到与破损率及脱净率分别相关的基础特性；基于第一数据集构建多元线性回归模型，得到两组预测模型；获取待评估的花生的特性数据，并基于特性数据中对应于第一相关特性以及第二相关特性的数值以及预测模型计算预测破损率与预测脱净率；基于预测破损率与预测脱净率得出待评估的花生的脱壳难度结论。本发明能够在有限条件下对花生品种进行快速评估，为新品种的开发提供理论依据。