本发明公开了基于RNP AR进近程序分段式越障降落航线优化方法及系统，其方法如下：A、按照目标机场降落跑道位置信息、目标机场地形数据通过RNP AR进近程序规划出RNP AR进近航线，并以RNPA R进近航线为中心划设出越障保护区；B、筛选出影响RNP AR进近航线各个航段的障碍物位置及障碍物高程信息，并计算得到RNP AR进近航线的航段的航路点的最低下降高度；C、将最后进近定位点之前的航段按照下滑角VPAk依次进行调整修改，同时对各个航路点的最低下降高度进行提升航路点高度调整修改，最后得到调整后的RNP AR进近航线并存储数据。本发明得到的RNP AR进近航线的各个定位点均获得降到的越障余度，具有更长、更稳定的下滑剖面，有效提升了飞行品质与运行安全。