本发明提供了一种冗余供电系统及其控制方法，其中该系统包括动力电池、DCDC转换器、主蓄电池、电源隔离模块和备用蓄电池，电源隔离模块中设有总线路、并联设置的第一线路和第二线路，第一线路的一端与主供电回路相连，其另一端与总线路相连；第二线路的一端与备用蓄电池相连，其另一端与总线路相连；第一线路上串联设置有MOSFET Q1、MOSFET Q2，第二线路上串联设置有MOSFET Q3、MOSFET Q4；电源隔离模块中还具有第一监控电路、第二监控电路、第一驱动电路和第二驱动电路；备用蓄电池上设有与电源隔离模块通讯连接的电池电量传感器。本发明能够保证整车的正常用电，保证备用蓄电池的可靠性和寿命。