本发明公开了一种基于迁移学习的颅内血管造影增强三维模型的建立方法，包括：获取亮血图像组、黑血图像组和增强黑血图像组；预处理得到第一亮血图像和第一黑血图像；对每个第一亮血图像以对应的第一黑血图像为基准，利用基于高斯分布抽样的互信息和图像金字塔的配准方法得到配准后亮血图像组；流空伪影消除得到伪影消除增强黑血图像组；将伪影消除增强黑血图像组和黑血图像组中对应图像相减得到K个造影增强图；利用配准后亮血图像组，采用迁移学习方法建立血液三维模型，利用所述配准后亮血图像组建立血液边界扩展的血管三维模型。本发明的方法能够在临床上简便、快速、直观地获得颅内血管整体状态以进行颅内血管病变分析。