本发明涉及永磁同步直线电机领域，具体的是一种永磁同步直线电机的模型预测控制系统及其方法。首先，建立永磁同步直线电机在两相同步旋转正交坐标系上的动态模型，并将其离散化；其次，引入增量关系得到系统的增广模型；然后，基于预测步长得到预测输出向量的表达式，根据线性二次型最优控制理论设计模型预测控制器；最后，对级联型的控制结构，分别设计了速度环和电流环的模型预测控制器。本发明最重要的特征是基于建立在两相同步旋转正交坐标系上的离散化数学模型，而设计的模型预测控制器具有良好的动态性能和稳态精度，并且控制系统具有很强的鲁棒性，适用于永磁同步直线电机伺服控制系统的设计。