本发明涉及一种黄曲霉素B1分子印迹聚合物的制备方法，该方法利用单醛对壳聚糖进行预交联；所得的预交联壳聚糖与甲基环氧氯丙烷反应得到壳聚糖环氧树脂预聚物；壳聚糖环氧树脂预聚物与黄曲霉素B1混合后，进行聚合；对包埋了黄曲霉素B1的壳聚糖环氧树脂进行物理、化学清洗，最终得到壳聚糖环氧树脂。本发明利用亲水性壳聚糖作为聚合单体，首先用单醛封闭壳聚糖上的氨基反应位点，保证了壳聚糖环氧树脂预聚物的顺利合成；用单醛封闭壳聚糖上的氨基反应位点，保证了壳聚糖环氧树脂与黄曲霉素B1不会发生共价结合；单醛上的烷基链为黄曲霉素B1中的疏水基团提供了完美的疏水环境，使得壳聚糖环氧树脂预聚物与黄曲霉素B1具有良好的亲附性。