一种牦牛乳清低醇饮料的生产方法，利用牦牛乳干酪生产时产生的乳清为基本原料，添加青藏高原特产的青稞补充碳源，先以啤酒酵母发酵，再用乳酸菌继续发酵，对发酵液进行分离、提纯、灭菌后，得到一种富含维生素、氨基酸、多种矿物质、酸甜适口的低醇饮料。本发明制备出的发酵型乳清低醇饮料，发酵产物中除了含有少量酒精，还含有大量的维生素、矿物元素和具有生物活性的微生物代谢产物，提高了饮料的生理功能特性，而且生产工艺简单，生产成本低，产品质量高，而且无废水污染环境。