本发明公开了一种微小隐孢子虫重组抗原基因MUCIN，及其表达的融合蛋白重组抗原rMUCIN，随机取的520份健康人血清，用重组抗原rMUCIN和rCp23做检测抗原，ELISA检测人血清IgG抗体，用spss软件对数据进行分析rMUCIN蛋白质与rCP23蛋白质检测未知血清阳性率相同（XC2=0.370；P=0.543＞0.05），而rMUCIN蛋白质检测未知血清阳性率高于微小隐孢子虫粗抗原（XC2=5.222；P=0.02＜0.05）。本发明还提供了ELISA检测抗微小隐孢子虫IgG抗体的试剂盒，它是以重组抗原rMUCIN做检测抗原，以rCp23做阳性对照，特异性、敏感性和可靠性更强。