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公开(公告)号：CN114901395B
公开(公告)日：2024-11-05
申请号：CN202080090348.8
申请日：2020-11-25
申请人： 10X基因组学有限公司
发明人： 拉吉夫·巴拉德瓦杰 , 金汉友 , 比尔·耿立·林 , 玛丽萨·彭内尔 , 阿利雷扎·萨曼扎德赫 , 马丁·索扎德 , 托拜厄斯·丹尼尔·惠勒
摘要： 提供了用于产生液滴的装置、系统及其使用方法。装置、系统和方法可以包括将第一液体输送通过通道的出口，并引起出口和第二液体的界面的相对运动，以在第二液体中产生第一液体的液滴。装置、系统和方法还可以包括当液体从出口离开时照射液体的一部分。本发明还提供了用于改变液滴的尺寸和用于从多个液滴中消除液滴的方法、装置和系统。
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公开(公告)号：CN118201982A
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202380014308.9
申请日：2023-08-17
申请人： 10X基因组学有限公司
IPC分类号： C08G65/00 , C08G65/336 , C09D171/00
摘要： 本发明提供了交联氟碳化合物表面涂层、其套件、具有交联含氟聚合物表面涂层的微流体装置，以及用于生成液滴的方法。这些套件、装置及其方法使用涂覆有通过氟碳硅烷和氟碳多元醇的反应而产生的交联含氟聚合物表面涂层的液滴源区域。
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公开(公告)号：CN117751197A
公开(公告)日：2024-03-22
申请号：CN202280048546.7
申请日：2022-06-01
申请人： 10X基因组学有限公司 , 李浩晢 , 奥尔加·苏洛娃
发明人： 李浩晢 , 奥尔加·苏洛娃 , 豪尔赫·伊万·埃尔南德斯·纽塔 , 马茨·尼尔森·伯尼茨
IPC分类号： C12Q1/6853
摘要： 本公开在一些方面涉及直接RNA(dRNA)检测方法，所述dRNA检测方法包括使用具有不对称臂的可环化探针(例如，挂锁探针)、连接的可环化探针的滚环扩增和原位检测(例如，使用基于杂交的原位测序)对生物样品中的核酸序列(例如，诸如SNP和点突变的短序列)进行多重空间分析。在一些方面，本文公开的方法和组合物提高了检测特异性，减少了假阳性信号检测，和/或保持或提高了检测效率。
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公开(公告)号：CN117746422A
公开(公告)日：2024-03-22
申请号：CN202311242220.0
申请日：2020-11-18
申请人： 10X基因组学有限公司
摘要： 提供了用于分析物的空间分析的系统和方法。获得一种数据结构，其包含具有标识符、基准标记和一组捕获点的基底上的样品的图像，作为像素值阵列。所述像素值用于标识导出基准点。基底标识符标识具有参考基准点的参考位置和对应的坐标系的模板。使用对齐算法将所述导出基准点与所述参考基准点对齐，以获得所述导出基准点与所述参考基准点之间的变换。所述变换和所述模板对应的坐标系用于将所述图像配准到所述一组捕获点。然后结合与每个捕获点相关联的空间分析物数据来分析所配准的图像，从而执行分析物的空间分析。
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公开(公告)号：CN117604074A
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202311574737.X
申请日：2018-11-16
申请人： 10X基因组学有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , G16B20/00 , G16B35/20
摘要： 本文提供了用于关联生物颗粒的物理和遗传特性的方法和系统。具体地，本文提供了用于处理来自生物颗粒(例如，细胞)的核酸分子的方法和系统。可产生多个分配区(例如，液滴)，以使多个分配区中的分配区各自包括包含核酸分子的生物颗粒(例如，细胞)和颗粒(例如，珠粒)。可对分配区进行处理(例如，成像)，以获得它们相应的生物颗粒的一种或多种物理和/或光学特性。可对包括在分配区中的核酸分子进行条形码化和测序(例如，使用偶合于分配区的颗粒的核酸条形码分子)以产生核酸分子的核酸序列。核酸序列可与生物颗粒的一种或多种光学特性以电子方式关联。
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公开(公告)号：CN117321195A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202280035389.6
申请日：2022-04-29
申请人： 10X基因组学有限公司
IPC分类号： C12N9/12
摘要： 本申请提供了包含具有至少一种改变的逆转录酶相关活性的经工程改造的融合逆转录酶的组合物。所述经工程改造的融合逆转录酶出乎意料地表现出一种或多种改变的逆转录酶相关活性，诸如但不限于改变的模板转换效率、改变的转录效率或两者。
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公开(公告)号：CN110770352B
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN201880017886.7
申请日：2018-11-16
申请人： 10X基因组学有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , G16B35/00 , G16B20/00
摘要： 本文提供了用于处理来自生物颗粒(例如，细胞)的核酸分子的方法和系统。可产生多个分配区(例如，液滴)，以使多个分配区中的分配区各自包括包含核酸分子的生物颗粒(例如，细胞)和颗粒(例如，珠粒)。可对分配区进行处理(例如，成像)，以获得它们相应的生物颗粒的一种或多种物理和/或光学特性。可对包括在分配区中的核酸分子进行条形码化和测序(例如，使用偶合于分配区的颗粒的核酸条形码分子)以产生核酸分子的核酸序列。核酸序列可与生物颗粒的一种或多种光学特性以电子方式关联。
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公开(公告)号：CN117178061A
公开(公告)日：2023-12-05
申请号：CN202280028993.6
申请日：2022-02-22
申请人： 10X基因组学有限公司
发明人： 大卫·迈克尔·帕特森
IPC分类号： C12Q1/6804
摘要： 本公开涉及使用单细胞谱分析方法检测和分析健康和患病细胞的糖基化和蛋白质特异性糖基化模式的方法、组合物、系统和试剂盒。
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公开(公告)号：CN110592182B
公开(公告)日：2023-11-28
申请号：CN201910621839.X
申请日：2014-06-26
申请人： 10X基因组学有限公司
发明人： 本杰明·辛德森 , 克里斯多佛·辛德森 , 迈克尔·史诺-莱文 , 凯文·奈斯 , 米尔娜·雅罗什 , 唐纳德·马斯克利耶 , 瑟奇·萨克森诺夫 , 兰登·梅里尔 , 安德鲁·普莱斯 , 保罗·哈登伯尔 , 媛·李
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6813 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要： 用于样品处理，尤其是用于测序应用的方法和组合物。用于附接至含有条形码的大量寡核苷酸的珠子的多样性文库的珠子组合物。方法包括制备条形码化珠子的文库的方法以及使珠子与样品组合的方法，例如通过使用微流体装置。第一分区包含与之关联的多个核酸条形码分子，且所述核酸条形码分子可包含相同的核酸条形码序列。所述第一分区可与样品材料的组分共同分配至第二分区，然后可将所述条形码分子从所述第一分区释放至所述第二分区内。释放的条形码分子附接至所述第二分区内的样品材料的组分或其片段。所述第一分区可包含至少1,000,000
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公开(公告)号：CN110214186B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN201880008233.2
申请日：2018-01-30
申请人： 10X基因组学有限公司
发明人： 扎哈拉·卡米拉·贝尔霍钦 , 拉吉夫·巴拉德瓦杰 , 克里斯多佛·辛德森 , 迈克尔·史诺-莱文 , 比尔·林 , 安东尼·马卡若维茨 , 普拉纳夫·帕特尔 , 凯瑟琳·法伊弗 , 安德鲁·D·普莱斯 , 穆罕默德·拉希米伦吉 , 托拜厄斯·丹尼尔·惠勒 , 尹沂峰
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/6806
摘要： 或病毒小群体的试剂盒。本文提供了用于样品制备技术的方法和系统，所述样品制备技术允许可能目标单细胞的扩增例如全基因组扩增、逆转录、细胞核酸的扩增等和测序。所述方法和系统通常通过将包含多个生物颗粒的第一液相、包含凝胶珠粒的第二液相和第三不混溶相集合在一起来操作。所述液相可相互作用以形成分区。所述方法和系统可被配置来允许在所述分区内实施单个操作或多个操作化学和/或生物化学加工。本公开的另一方面提
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