公开(公告)号：CN118588174A

公开(公告)日：2024-09-03

申请号：CN202410817220.7

申请日：2024-06-21

申请人： 上海分子之心智能科技有限公司

发明人： 许锦波 ,  谭无为

IPC分类号： G16B40/00 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/084

摘要： 本申请的目的是提供一种用于确定抗原抗体对接信息的方法与设备，该方法包括：基于抗原信息与抗体信息，利用深度学习网络，获取相应的抗原抗体对接信息，其中，所述抗原信息包括抗原序列信息与抗原结构信息，所述抗体信息包括抗体序列信息与抗体结构信息，所述深度学习网络包括编码器‑解码器架构，所述抗原抗体对接信息包括抗原抗体复合物结构信息。该深度学习网络对未结合的抗原、抗体的结合结构进行预测，不仅预测了抗原抗体结合的结构，还预测了抗原和抗体由未结合到结合状态中自身的结构的转变。利用编码器‑解码器架构进行结合结构预测有效提升计算效率与预测准确性。

公开(公告)号：CN117672364A

公开(公告)日：2024-03-08

申请号：CN202311758039.5

申请日：2023-12-19

申请人： 上海分子之心智能科技有限公司

发明人： 许锦波 ,  井晓阳 ,  王效涛 ,  王腾龙 ,  谭无为

IPC分类号： G16B20/50 ,  G16B40/20 ,  G06N3/042 ,  G06N3/09

摘要： 本申请的目的是提供一种用于预测蛋白质突变稳定性的方法、设备及介质，该方法包括：获取预训练蛋白质语言模型与预训练蛋白质结构模型；基于蛋白质突变训练数据、预训练蛋白质语言模型、预训练蛋白质结构模型，构建图神经网络；基于蛋白质适应度数据和蛋白质突变自由能变化数据，结合图神经网络，训练得到蛋白质突变稳定性预测模型；基于目标蛋白质突变数据，利用预训练蛋白质语言模型、预训练蛋白质结构模型、图神经网络与蛋白质突变稳定性预测模型，确定目标蛋白质突变数据对应的蛋白质突变稳定性信息。本申请通过综合信息融合的方式，有效整合各类特征数据，来预测蛋白质突变引起的稳定性变化，有效提升了蛋白质突变影响预测的全面性和准确性。

公开(公告)号：CN117672364B

公开(公告)日：2024-05-14

申请号：CN202311758039.5

申请日：2023-12-19

申请人： 上海分子之心智能科技有限公司

发明人： 许锦波 ,  井晓阳 ,  王效涛 ,  王腾龙 ,  谭无为

IPC分类号： G16B20/50 ,  G16B40/20 ,  G06N3/042 ,  G06N3/09

摘要： 本申请的目的是提供一种用于预测蛋白质突变稳定性的方法、设备及介质，该方法包括：获取预训练蛋白质语言模型与预训练蛋白质结构模型；基于蛋白质突变训练数据、预训练蛋白质语言模型、预训练蛋白质结构模型，构建图神经网络；基于蛋白质适应度数据和蛋白质突变自由能变化数据，结合图神经网络，训练得到蛋白质突变稳定性预测模型；基于目标蛋白质突变数据，利用预训练蛋白质语言模型、预训练蛋白质结构模型、图神经网络与蛋白质突变稳定性预测模型，确定目标蛋白质突变数据对应的蛋白质突变稳定性信息。本申请通过综合信息融合的方式，有效整合各类特征数据，来预测蛋白质突变引起的稳定性变化，有效提升了蛋白质突变影响预测的全面性和准确性。