一种与香猪产仔数相关的PAV3分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN106399524B

    公开(公告)日:2019-11-19

    申请号:CN201610886974.3

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的PAV3标记,其特征在于:PAV3标记是指猪基因组中,候选区域chr3:46248125‑46346800的结构变异,该区域缺失98675bp片段,或不缺失。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,在香猪基因组结构变异中,基因型DD型的香猪的产仔数高于基因型AA型的相应产仔数(P

    一种依据ARNT基因中结构变异SV323区分大白猪和贵州地方猪品种的检测技术

    公开(公告)号:CN112646896A

    公开(公告)日:2021-04-13

    申请号:CN202011547922.6

    申请日:2020-12-24

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种依据ARNT基因中结构变异SV323区分大白猪和贵州地方猪品种的分子标记及检测技术,其特征在于:SV323位于猪参考基因组Sscrofa 11.1 chr4:98349210‑98349532,共323bp,存在ARNT基因第一内含子中,SV323缺失基因定为D,正常不缺失的基因定为I。应用本发明所述的检测技术,得出大白猪II基因型频率显著高于其它贵州地方猪品种的II基因型;大白猪以不缺失的I基因为主,而贵州地方猪品种以缺失的D基因为主,应用分子标记SV323可以区分大白猪和贵州地方猪品种。

    一种鉴别香猪与大白猪的结构变异SMC1A基因中SV320分子标记及其检测技术

    公开(公告)号:CN110343772A

    公开(公告)日:2019-10-18

    申请号:CN201910819953.3

    申请日:2019-08-31

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别香猪和大白猪的结构变异SV320,其特征在于:SV320位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chrx:46186712-46187032,SV320缺失基因定为D,正常不缺失的基因定为I。应用本发明所述的检测技术,检测样品的SV320基因型,发现香猪只存在一种基因型,则为DD型,等为基因频率D为100%,对于大白猪无纯合缺失型(DD),只存在DI和II型,以II型为主。因此可应用结构变异SV320作为分子标记区分大白猪和中国地方猪品种香猪。

    一种与香猪产仔数相关的PAV3分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN106399524A

    公开(公告)日:2017-02-15

    申请号:CN201610886974.3

    申请日:2016-10-11

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的PAV3标记,其特征在于:PAV3标记是指猪基因组中,候选区域chr3:46248125-46346800的结构变异,该区域缺失98675bp片段,或不缺失。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,在香猪基因组结构变异中,基因型DD型的香猪的产仔数高于基因型AA型的相应产仔数(P

    一种与香猪产仔数相关的SV5标记及其检测方法

    公开(公告)号:CN106148522A

    公开(公告)日:2016-11-23

    申请号:CN201610533169.2

    申请日:2016-07-08

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了一种与香猪产仔数相关的SV5标记,其特征在于:SV5标记是指猪基因组中,候选区域chr3:58983698‑58983852的结构变异,该区域缺失结构变异155bp片段,或不缺失。对香猪繁殖性状和结构的关联分析显示,SV5缺失或正常对其产仔数有显著影响,其中SV5缺失个体总产仔数显著高于SV5正常的个体(P<0.05)。

    一种鉴别大白猪和贵州地方猪品种的LCORL基因中结构变异SV426分子标记

    公开(公告)号:CN110373482A

    公开(公告)日:2019-10-25

    申请号:CN201910819724.1

    申请日:2019-08-31

    Applicant: 贵州大学

    Abstract: 本发明公开了“一种鉴别大白猪和贵州地方猪品种的LCORL基因中结构变异SV426分子标记”,其特征在于:结构变异SV426位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chr 8:12879574-12879999,缺失片段长度为426bp,处于LCORL基因内含子4中,结构变异SV426的缺失基因型定义为D,正常不缺失的基因型定义为I,大白猪I基因的频率显著高于贵州地方猪品种,可作为鉴别大白猪和贵州地方猪品种的分子标记。

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