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公开(公告)号：CN113380324B
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202110536816.6
申请日：2021-05-17
Applicant: 西安交通大学
Abstract: 本发明公开了一种T细胞受体序列motif组合识别检测方法、存储介质及设备，构建Tumor‑Health矩阵和Tissue‑Blood矩阵作为输入矩阵；以motif组合的类内类间距离可分性作为优化目标函数；设计双种群遗传算法，对输入矩阵中的每一motif列和label列进行相关性分析，采用点二列相关性作为衡量motif列和label列是否相关的指标；以优化目标函数作为算法优化目标，利相关性指标对输入矩阵的motif进行初步筛选，过滤掉不相关的motif列，通过遗传算法进行迭代计算，得到两组种群的优势解，取两组种群中适应度排前三的染色体作为最优解，并解码成为对应的motif集合，取对应集合的交集作为最终挖掘出的motif，完成识别检测。本发明能够为免疫治疗提供可能的生物标志物研究方向。
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公开(公告)号：CN113380324A
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202110536816.6
申请日：2021-05-17
Applicant: 西安交通大学
Abstract: 本发明公开了一种T细胞受体序列motif组合识别检测方法、存储介质及设备，构建Tumor‑Health矩阵和Tissue‑Blood矩阵作为输入矩阵；以motif组合的类内类间距离可分性作为优化目标函数；设计双种群遗传算法，对输入矩阵中的每一motif列和label列进行相关性分析，采用点二列相关性作为衡量motif列和label列是否相关的指标；以优化目标函数作为算法优化目标，利相关性指标对输入矩阵的motif进行初步筛选，过滤掉不相关的motif列，通过遗传算法进行迭代计算，得到两组种群的优势解，取两组种群中适应度排前三的染色体作为最优解，并解码成为对应的motif集合，取对应集合的交集作为最终挖掘出的motif，完成识别检测。本发明能够为免疫治疗提供可能的生物标志物研究方向。
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