公开(公告)号：CN111424104A

公开(公告)日：2020-07-17

申请号：CN202010072685.6

申请日：2020-01-21

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 孙淑静 ,  许欣 ,  柳婷 ,  孔旭强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/06 ,  C12Q1/04 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了一种基于细菌群落组成与丰度快速判断杏鲍菇菌种衰退的方法及其应用，属于食用菌技术领域。该方法包括：1)待测杏鲍菇菌株菌丝通过Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序；2)高通量测序数据过滤去杂后根据97%以上相似性进行聚类，以测序所有序列数的0.005%作为阈值过滤OTU，获得菌株菌丝的细菌组成以及菌群丰度；3)通过获得的细菌多样性指数以及菌群丰度快速判断杏鲍菇菌种是否衰退。全面了解杏鲍菇菌种的细菌组成以及结构情况，基于多样性指数以及菌群丰度判断杏鲍菇菌种是否衰退，为工厂快速判断杏鲍菇菌种是否衰退提供一种新的判断指标。

公开(公告)号：CN110714094B

公开(公告)日：2022-06-03

申请号：CN201911157587.6

申请日：2019-11-22

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 孙淑静 ,  孔旭强 ,  刘云超

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明提供了一种特异性鉴定银耳菌株的SCAR分子标记及其鉴定方法和应用，SCAR分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，或与SEQ ID NO：1所示序列中前后两端30bp内的中间序列一致，或与SEQ ID NO：1所示序列中前后两端30bp内的中间序列相似度达99％以上。本发明还提供了基于SCAR分子标记设计的引物，利用该SCAR分子标记和引物可对不同银耳品种进行鉴定，能快速有效的鉴定出银耳TWW01‑AX菌株，其具有操作简单、耗时短，特异性强等优点。

公开(公告)号：CN111424104B

公开(公告)日：2022-11-04

申请号：CN202010072685.6

申请日：2020-01-21

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 孙淑静 ,  许欣 ,  柳婷 ,  孔旭强

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/06 ,  C12Q1/04 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明公开了一种基于细菌群落组成与丰度快速判断杏鲍菇菌种衰退的方法及其应用，属于食用菌技术领域。该方法包括：1)待测杏鲍菇菌株菌丝通过Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序；2)高通量测序数据过滤去杂后根据97%以上相似性进行聚类，以测序所有序列数的0.005%作为阈值过滤OTU，获得菌株菌丝的细菌组成以及菌群丰度；3)通过获得的细菌多样性指数以及菌群丰度快速判断杏鲍菇菌种是否衰退。全面了解杏鲍菇菌种的细菌组成以及结构情况，基于多样性指数以及菌群丰度判断杏鲍菇菌种是否衰退，为工厂快速判断杏鲍菇菌种是否衰退提供一种新的判断指标。

公开(公告)号：CN110714094A

公开(公告)日：2020-01-21

申请号：CN201911157587.6

申请日：2019-11-22

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 孙淑静 ,  孔旭强 ,  刘云超

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/645

Abstract: 本发明提供了一种特异性鉴定银耳菌株的SCAR分子标记及其鉴定方法和应用，SCAR分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，或与SEQ ID NO：1所示序列中前后两端30bp内的中间序列一致，或与SEQ ID NO：1所示序列中前后两端30bp内的中间序列相似度达99％以上。本发明还提供了基于SCAR分子标记设计的引物，利用该SCAR分子标记和引物可对不同银耳品种进行鉴定，能快速有效的鉴定出银耳TWW01-AX菌株，其具有操作简单、耗时短，特异性强等优点。