一种地方鸡中低密度10K全基因组SNP液相芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117187410A

    公开(公告)日:2023-12-08

    申请号:CN202311218053.6

    申请日:2023-09-20

    Abstract: 本发明涉及一种地方鸡中低密度10K全基因组SNP液相芯片及其应用。本发明通过全基因组重测序技术获得地方鸡58个品种的955个个体的全基因组遗传信息,通过严格筛选获得45669个SNP分子标记组成的基础数据集,再进一步遴选出10046个SNP分子标记,并以遴选的SNP分子标记为检测靶点构建SNP液相芯片。本发明的SNP液相芯片具有目标区域数据覆盖度和均一性好、基因分型检出率高的优势,极大地降低了基因组分型成本。同时,计算其与高密度40K全基因组SNP液相芯片亲缘系数矩阵,平均相关系数达到95.18%,证明在采用基因组选择技术进行分子育种时,可以代替40K SNP的液相芯片,实现快速低成本。

    与鸡体尺性状相关的IGF2BP1基因分子标记及其应用和育种方法

    公开(公告)号:CN115198022B

    公开(公告)日:2024-05-14

    申请号:CN202111342786.1

    申请日:2021-11-12

    Abstract: 本发明涉及与鸡体尺性状相关的IGF2BP1基因分子标记及其应用和育种方法。本发明提供了一种与鸡体尺性状相关的IGF2BP1基因分子标记,通过对鸡IGF2BP1基因启动子区的缺失突变与23种鸡体尺性状的相关性进行分析,发现该变异位点中等位基因L1与高体尺性状(爪重、胫长、胸骨长、双翅重等23个性状)显著正相关;等位基因W与鸡低体尺性状呈显著正相关。表明该分子标记能够应用于鸡体尺性状改良育种。本发明还提供了基于IGF2BP1基因分子标记的鸡体尺性状改良育种方法,该方法能够早期、快速、低成本、有效的预测鸡成长后体尺性状,缩短育种时间,加快育种进程,具有极高的经济价值和广阔的应用前景。

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