一种植物抗性蛋白识别方法、装置、设备和存储介质

    公开(公告)号:CN112906755A

    公开(公告)日:2021-06-04

    申请号:CN202110111933.8

    申请日:2021-01-27

    Inventor: 徐磊 王彦苏 邹权

    Abstract: 本申请提供了一种植物抗性蛋白识别方法、装置、设备和存储介质。方法包括:获取植物抗性蛋白的序列数据,组成正训练集、负训练集和测试集;提取正训练集和负训练集中的数据特征;将所有的数据特征进行拼接,获得特征集;进行特征选择,以获取目标特征子集;筛选出预设分类模型和预设k值;基于目标特征子集,对预设分类模型进行训练;基于测试集,对训练后的分类模型进行分类性能测试,直至获得性能满足预设条件的目标分类模型;基于目标分类模型,对序列数据进行结构域和跨膜蛋白预测,并搭建植物抗性蛋白分类预测器,以用于植物抗性蛋白识别。能够实现准确识别植物抗性蛋白。

    肿瘤基因共表达网络构建方法、装置、设备和存储介质

    公开(公告)号:CN112908405A

    公开(公告)日:2021-06-04

    申请号:CN202110113106.2

    申请日:2021-01-27

    Inventor: 徐磊 王彦苏 邹权

    Abstract: 本申请提供了一种肿瘤基因共表达网络构建方法、装置、设备和存储介质。所述方法包括:获取目标人体系统中的多种组织癌变转录组测序数据和所述多种组织的正常转录组测序数据;所述目标人体系统是人体解剖学八大人体系统中的任一人体系统;根据基因和转录本的关系,以及正常转录组测序数据中基因表达量呈现均一化的RNA,提取出多种组织的癌变转录组测序数据中存在差异的mRNA、lncRNA和miRNA;对所述多种组织的癌变差异mRNA、lncRNA和miRNA进行GO分析,得到融合为一个目标表达矩阵;对所述目标表达矩阵进行WGCNA分析,根据性状构建表达模块,取相关性最高的模块进行网络的构建。能够实现对多种癌症的网络构建。

    肿瘤基因共表达网络构建方法、装置、设备和存储介质

    公开(公告)号:CN112908405B

    公开(公告)日:2022-05-17

    申请号:CN202110113106.2

    申请日:2021-01-27

    Inventor: 徐磊 王彦苏 邹权

    Abstract: 本申请提供了一种肿瘤基因共表达网络构建方法、装置、设备和存储介质。所述方法包括:获取目标人体系统中的多种组织癌变转录组测序数据和所述多种组织的正常转录组测序数据;所述目标人体系统是人体解剖学八大人体系统中的任一人体系统;根据基因和转录本的关系,以及正常转录组测序数据中基因表达量呈现均一化的RNA,提取出多种组织的癌变转录组测序数据中存在差异的mRNA、lncRNA和miRNA;对所述多种组织的癌变差异mRNA、lncRNA和miRNA进行GO分析,得到融合为一个目标表达矩阵;对所述目标表达矩阵进行WGCNA分析,根据性状构建表达模块,取相关性最高的模块进行网络的构建。能够实现对多种癌症的网络构建。

Patent Agency Ranking