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公开(公告)号：CN116013417A
公开(公告)日：2023-04-25
申请号：CN202211639837.1
申请日：2022-12-20
Applicant: 湖南大学
IPC: G16B40/00 , G16B50/00 , G06F18/241 , G06F18/22
Abstract: 本发明提供了基于马尔科夫模型的噬菌体分类的方法，以科层级为例，对某个科构建的马尔科夫模型，计算该模型与其他科的病毒基因组的对数似然值LL，使用这些LL值拟合高斯分布的均值和方差从而得到该模型的对数似然值LL的高斯分布。在应用时，针对未分类的基因组得到LL值后，依据模型的高斯分布计算得到P值。后续可以根据P值划定可信度门槛。本发明不仅对较短的基因组片段(如几千碱基对长度)进行更准确的分类学分类指定，而且对与已知病毒基因组同源性较低的基因组片段预测指定准确的分类学分类。
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