癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法

    公开(公告)号:CN118800335A

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202411294838.6

    申请日:2024-09-14

    Applicant: 湖南大学

    Abstract: 癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法,当所述癌细胞为结直肠癌时,其线粒体生物标志物包括:OXCT1、CLPB、SLC25A12、MRPL51、SFXN1、GATM和TRMT10C基因。所述基于机器算法筛选的方法为:(1)将待筛选癌细胞的表达数据集进行标准化处理,再获得线粒体相关基因在癌细胞表达数据中的表达量;(2)差异分析,对差异表达的癌细胞线粒体基因或蛋白进行相关性分析,选择同时满足差异基因且属于线粒体相关基因的基因模块;(3)功能富集分析;(4)选用至少两种机器算法分别筛选,分别得特征基因或蛋白列表,确定核心交集靶点,即成。本发明方法高效、全面,所得线粒体生物标志物准确性高。

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