公开(公告)号：CN118800335A

公开(公告)日：2024-10-18

申请号：CN202411294838.6

申请日：2024-09-14

Applicant: 湖南大学

Inventor： 张英杰 ,  丁宁 ,  刘楠楠 ,  江美美

IPC: G16B35/20 ,  G16B40/00 ,  G16B25/10 ,  G06F18/2411 ,  G06F18/27

Abstract: 癌细胞线粒体生物标志物及基于机器算法筛选的方法，当所述癌细胞为结直肠癌时，其线粒体生物标志物包括：OXCT1、CLPB、SLC25A12、MRPL51、SFXN1、GATM和TRMT10C基因。所述基于机器算法筛选的方法为：（1）将待筛选癌细胞的表达数据集进行标准化处理，再获得线粒体相关基因在癌细胞表达数据中的表达量；（2）差异分析，对差异表达的癌细胞线粒体基因或蛋白进行相关性分析，选择同时满足差异基因且属于线粒体相关基因的基因模块；（3）功能富集分析；（4）选用至少两种机器算法分别筛选，分别得特征基因或蛋白列表，确定核心交集靶点，即成。本发明方法高效、全面，所得线粒体生物标志物准确性高。

公开(公告)号：CN119274645A

公开(公告)日：2025-01-07

申请号：CN202411553271.X

申请日：2024-11-01

Applicant: 湖南大学

Inventor： 丁宁 ,  张英杰 ,  贾桂云 ,  胡新宇

IPC: G16B15/30 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00 ,  G16H70/40

Abstract: 一种天马Ⅲ号方治疗结直肠癌作用机制的分析方法，包括：（1）筛选结直肠癌疾病靶点；（2）检索天马Ⅲ号方的药物组成，得天马Ⅲ号方有效活性成分靶点；（3）取交集，得交集靶点；（4）构建“成分‑靶点‑疾病”共表达网络图及多个蛋白蛋白相互作用网络图，得潜在核心靶点；交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析；潜在核心靶点与关键化合物分子进行分子对接；体外实验验证天马Ⅲ号方抑制结直肠癌细胞增殖以及促进凋亡；实时荧光定量法验证天马Ⅲ号方对潜在核心靶点mRNA表达水平的影响。本发明方法分析系统全面，误差少，预测速度和效率高，降低药物筛选、开发成本，为结直肠癌的防治提供科学依据，给其它复方的研究提供参考价值。