时空转录组测序方法、构建测序文库方法和基因测序系统

    公开(公告)号:CN119487209A

    公开(公告)日:2025-02-18

    申请号:CN202280097967.9

    申请日:2022-12-30

    Abstract: 本发明公开了一种时空转录组测序方法、构建测序文库方法和基因测序系统。本发明的时空转录组测序方法包括以下步骤:1)以探针序列3′端与模板RNA 3′端互补结合进行逆转录,并利用逆转录酶在所生成cDNA的末端添加模板转换寡核苷酸序列,所述模板转换寡核苷酸序列与所述探针序列5′端的第一接头序列不同;2)利用所述第一接头序列和所述模板转换寡核苷酸序列对所述cDNA进行扩增;3)对步骤2)扩增的所述cDNA进行测序。利用本发明的方法可以缩短时空转录组测序的时间,并且可以实现时空转录组的5′端测序。

    一种检测核酸内切酶酶切位点的方法

    公开(公告)号:CN109207571B

    公开(公告)日:2022-01-04

    申请号:CN201710522336.8

    申请日:2017-06-30

    Abstract: 本发明公开了一种检测核酸内切酶酶切位点的方法。本发明利用芯片上数以十亿计的核酸序列来高通量系统性的检测核酸内切酶对DNA的识别切割位点及核心序列特征,采用两次测序分别获取碱基序列及正常的双链DNA,同时根据酶切前后荧光信号的改变,运用生物信息分析方法得到内切酶的识别切割位点。通过对内切酶识别切割位点的研究,可检测内切酶的识别切割位点的倾向性,并且可以提前预测内切酶的星号活性及基因组编辑技术中内切酶的脱靶效应,同时,也可用于大规模筛选新型基因组编辑系统中使用的内切酶所需要识别的PAM序列。与现有技术中的测序方法相比,本发明的检测方法具有速度快且通量高的优势。

    分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法

    公开(公告)号:CN113039283A

    公开(公告)日:2021-06-25

    申请号:CN201880099543.X

    申请日:2018-12-12

    Abstract: 一种分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法。所述方法包括选自如下(a)或(b)的步骤:(a)将固定在固相载体上的宿主源探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的宿主源核酸和保留在液体样品中的病原核酸;(b)将宿主源探针、固定在固相载体上的病原探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交、病原探针与病原核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的病原核酸和保留在液体样品中的宿主源核酸。该方法使用宿主源探针特异性捕获宿主源核酸,通过分离宿主源核酸来实现病原核酸的富集。

    检测蛋白质DNA结合位点的方法

    公开(公告)号:CN111349690A

    公开(公告)日:2020-06-30

    申请号:CN201811584980.9

    申请日:2018-12-24

    Abstract: 本发明提出了检测蛋白质DNA结合位点的方法。包括:将DNA片段库进行测序;去除测序后的DNA片段库中的新生链;以DNA片段库的DNA片段为模板,将不带有荧光标记的dNTP依次聚合在测序接头的3’端,将带有荧光标记的dNTP聚合在聚合产物3’端的最后一位;记录聚合反应后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度;将目标蛋白与所述聚合反应后的DNA片段库进行杂交,所述目标蛋白具有荧光修饰;记录杂交后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度;基于杂交后的DNA片段库中的荧光点与聚合反应后的DNA片段库中荧光点的荧光强度或荧光种类的差异,确定目标蛋白质DNA结合位点。

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