异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用

    公开(公告)号:CN111349712B

    公开(公告)日:2022-07-12

    申请号:CN202010169767.2

    申请日:2020-03-12

    Abstract: 本发明公开了异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。本发明提供了特定DNA片段或其相关生物材料在培育抗旱棉花品种或品系或提高棉花抗旱性中的应用;所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365(SEQ ID No.1)起至SSR分子标记JAAS5604(SEQ ID No.2)止的片段;所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。本发明所提供的染色体片段在抗旱棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的抗旱棉花品种提供分子基础。

    棉花高衣分相关的SSR核酸序列及其应用

    公开(公告)号:CN110129475B

    公开(公告)日:2022-07-12

    申请号:CN201910384750.6

    申请日:2019-05-09

    Abstract: 本发明公开了棉花高衣分相关的SSR核酸序列及其应用。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段,为位于异常棉5号染色体上自SSR分子标记JAAS6365起至SSR分子标记JAAS5604止的片段;所述SSR分子标记JAAS6365的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述SSR分子标记JAAS5604的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的染色体片段在高衣分棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的高衣分棉花品种提供分子基础。

    与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记

    公开(公告)号:CN110093442B

    公开(公告)日:2022-07-12

    申请号:CN201910384208.0

    申请日:2019-05-09

    Abstract: 本发明公开了与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段,为位于异常棉11号染色体上自SSR分子标记NAU2877起至SSR分子标记JAAS4311止的片段;所述SSR分子标记NAU2877的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述SSR分子标记JAAS4311的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的染色体片段在矮杆和高衣分棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的矮杆高衣分棉花品种提供分子基础。

    能引起陆地棉致死的异常棉染色体片段及分子标记和应用

    公开(公告)号:CN111763757B

    公开(公告)日:2022-06-28

    申请号:CN202010594408.1

    申请日:2020-06-24

    Abstract: 本发明公开了一种能引起陆地棉致死的异常棉染色体片段及其分子标记和应用,所述染色体片段A11‑9来自于异常棉,位于棉花染色体组的第11号染色体,通过6对SSR标记:NAU5192、A11_175、JAAS3191、A11_243、JAAS3310、A11_193标记,以异常棉的DNA为模板,使用6对SSR标记同时对异常棉的DNA扩增,同时含有6对SSR标记的目的条带的染色体片段即为异常棉的染色体片段A11‑9;本发明获得了源于异常棉致死性状的单片段渐渗系,为促进目标基因的精细定位及其以后的图位克隆创造了重要材料。利用本发明的分子标记,可为渐渗系致死形成的分子机制研究奠定技术基础。

    异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用

    公开(公告)号:CN111349712A

    公开(公告)日:2020-06-30

    申请号:CN202010169767.2

    申请日:2020-03-12

    Abstract: 本发明公开了异常棉来源的抗旱相关SSR序列及其应用。本发明提供了特定DNA片段或其相关生物材料在培育抗旱棉花品种或品系或提高棉花抗旱性中的应用;所述特定DNA片段为位于异常棉5号染色体上至少含有自SSR分子标记JAAS6365(SEQ ID No.1)起至SSR分子标记JAAS5604(SEQ ID No.2)止的片段;所述相关生物材料为含有所述特定DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。本发明所提供的染色体片段在抗旱棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的抗旱棉花品种提供分子基础。

    与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记

    公开(公告)号:CN110093442A

    公开(公告)日:2019-08-06

    申请号:CN201910384208.0

    申请日:2019-05-09

    Abstract: 本发明公开了与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段,为位于异常棉11号染色体上自SSR分子标记NAU2877起至SSR分子标记JAAS4311止的片段;所述SSR分子标记NAU2877的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述SSR分子标记JAAS4311的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的染色体片段在矮杆和高衣分棉花育种中具有重要应用价值,同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的矮杆高衣分棉花品种提供分子基础。

    一种批量计算LTR-反转座子插入时间的方法

    公开(公告)号:CN105808974A

    公开(公告)日:2016-07-27

    申请号:CN201610128929.1

    申请日:2016-03-07

    CPC classification number: G16B20/00

    Abstract: 本发明公开了一种批量计算LTR?反转座子插入时间的方法,具体步骤包括:将待测LTR?反转座子的LTRs序列放到一个文本文件中,命名为INPUT,INPUT文件需为fasta格式,并且LTR?反转座子两侧LTRs序列的ID以“|LTR1”或“|LTR2”结尾,运行事先编写的脚本即得到结果文件Insert_time,即为LTR?反转座子的插入时间。本发明所述的LTR?反转座子插入时间的计算方法速度快,效率高,实现了批量化、自动化和流程化计算。

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