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公开(公告)号：CN111755074A
公开(公告)日：2020-10-09
申请号：CN202010636957.0
申请日：2020-07-03
Applicant: 桂林电子科技大学
Abstract: 本发明公开了一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法，步骤为：获取酿酒酵母菌中的正样本序列和负样本序列；使用二进制编码法和PSEKNC-I两种方法提取特征；使用F-score和IFS方法对PSEKNC-I法得到的特征进行筛选，得到预筛选特征；将二进制编码法得到特征和预筛选特征进行组合，获得特征组合后的样本数据集；构建CNN预测模型并训练，输入数据获得初步预测结果；调整训练后CNN预测模型中参数，对训练后的CNN预测模型进行优化；使用五折交叉验证法对优化后的CNN预测模型进行评估最终得到最优的CNN预测模型，将数据输入最优模型中，得到最终的预测结果。该方法提取多种DNA信息中的特征，减少了计算时间，避免过拟合现象，选出最优的分类模型，提高了预测复制起点预测的准确率。
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公开(公告)号：CN110379464A
公开(公告)日：2019-10-25
申请号：CN201910688863.5
申请日：2019-07-29
Applicant: 桂林电子科技大学
Abstract: 本发明公开了一种细菌中DNA转录终止子的预测方法，包括如下步骤：1）获取细菌的终止子和非终止子序列作为基准数据集和独立数据集；2）特征集提取；3）特征集排序；4）特征集选择；5）特征集提取方法对比；6）训练模型；7）构建组合分类器；8）方法评估。这种预测方法可以提取多种DNA信息中的特征，还减少了计算时间，避免出现过拟合现象，同时还可以选出最优的分类模型，提高了预测终止子预测的准确率。
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公开(公告)号：CN111755074B
公开(公告)日：2022-05-17
申请号：CN202010636957.0
申请日：2020-07-03
Applicant: 桂林电子科技大学
Abstract: 本发明公开了一种酿酒酵母菌中DNA复制起点的预测方法，步骤为：获取酿酒酵母菌中的正样本序列和负样本序列；使用二进制编码法和PSEKNC‑I两种方法提取特征；使用F‑score和IFS方法对PSEKNC‑I法得到的特征进行筛选，得到预筛选特征；将二进制编码法得到特征和预筛选特征进行组合，获得特征组合后的样本数据集；构建CNN预测模型并训练，输入数据获得初步预测结果；调整训练后CNN预测模型中参数，对训练后的CNN预测模型进行优化；使用五折交叉验证法对优化后的CNN预测模型进行评估最终得到最优的CNN预测模型，将数据输入最优模型中，得到最终的预测结果。该方法提取多种DNA信息中的特征，减少了计算时间，避免过拟合现象，选出最优的分类模型，提高了预测复制起点预测的准确率。
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公开(公告)号：CN110379464B
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN201910688863.5
申请日：2019-07-29
Applicant: 桂林电子科技大学
Abstract: 本发明公开了一种细菌中DNA转录终止子的预测方法，包括如下步骤：1）获取细菌的终止子和非终止子序列作为基准数据集和独立数据集；2）特征集提取；3）特征集排序；4）特征集选择；5）特征集提取方法对比；6）训练模型；7）构建组合分类器；8）方法评估。这种预测方法可以提取多种DNA信息中的特征，还减少了计算时间，避免出现过拟合现象，同时还可以选出最优的分类模型，提高了预测终止子预测的准确率。
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