一种改进的基于协同过滤的miRNA-疾病关联预测方法

    公开(公告)号:CN107506608A

    公开(公告)日:2017-12-22

    申请号:CN201710902248.0

    申请日:2017-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种改进的基于协同过滤的miRNA-疾病关联预测方法。miRNA-疾病预测问题可以看作是一种推荐修补问题。基于已知miRNA疾病关联的二分网络,根据miRNA对相关疾病的已知偏好,推荐使用miRNA,反之亦然。首先定义和计算测量一种疾病对另一种疾病的重要性矩阵SIGd。当疾病d(i)认为疾病d(j)更重要时,SIGd(d(i),d(j))的得分更高。类似地定义和计算SIGr以测量两种miRNA的重要性。其次使用显著矩阵和相似矩阵作为权重来计算得分。相似性矩阵被定义为表示miRNA或疾病之间的相似性,则miRNA-疾病关联的最终得分是miRNA与疾病的评分分数和该疾病对miRNA的评分评分的总和。本发明实现了更高的预测精度。

    一种改进的基于协同过滤的miRNA-疾病关联预测方法

    公开(公告)号:CN107506608B

    公开(公告)日:2020-09-29

    申请号:CN201710902248.0

    申请日:2017-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种改进的基于协同过滤的miRNA‑疾病关联预测方法。miRNA‑疾病预测问题可以看作是一种推荐修补问题。基于已知miRNA疾病关联的二分网络,根据miRNA对相关疾病的已知偏好,推荐使用miRNA,反之亦然。首先定义和计算测量一种疾病对另一种疾病的重要性矩阵SIGd。当疾病d(i)认为疾病d(j)更重要时,SIGd(d(i),d(j))的得分更高。类似地定义和计算SIGr以测量两种miRNA的重要性。其次使用显著矩阵和相似矩阵作为权重来计算得分。相似性矩阵被定义为表示miRNA或疾病之间的相似性,则miRNA‑疾病关联的最终得分是miRNA与疾病的评分分数和该疾病对miRNA的评分评分的总和。本发明实现了更高的预测精度。

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