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公开(公告)号：CN115064209B
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202210988485.4
申请日：2022-08-17
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开一种恶性细胞鉴定方法及系统，所述方法包括：获取单细胞转录组测序数据；基于单细胞转录组测序数据计算基因拷贝数变异鉴定恶性细胞所需的数据，并基于数据确定基因拷贝数变异的方向、程度以及等位基因失衡程度；基于基因拷贝数变异的方向、程度以及等位基因失衡程度进行第一细胞聚类确定首次确定的疑似非恶性细胞和疑似恶性细胞；基于首次确定的疑似非恶性细胞和疑似恶性细胞，根据肿瘤特征分值与非肿瘤特征分值进行第二细胞聚类确定最终的非恶性细胞和恶性细胞。本发明还公开了对应的电子设备以及计算机可读存储介质，融合监督性和非监督性两大技术路线，不依赖肿瘤组织和癌旁组织群细胞转录组测序数据，提高了对恶性细胞鉴定敏感性。
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公开(公告)号：CN113684274B
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202010421637.3
申请日：2020-05-18
Applicant: 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及用于女性恶性生殖细胞肿瘤诊断和治疗试剂盒，所述试剂盒包括OVOL2表达水平的检测试剂以及用于化疗的顺铂药物。通过采用本发明用于女性恶性生殖细胞肿瘤诊断和治疗试剂盒，有助于提早预测女性恶性生殖细胞肿瘤对顺铂化疗的敏感程度，从而优化治疗方案，减少不必要的化疗，提高患者生活质量的同时改善患者的预后。
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公开(公告)号：CN114561472A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210452387.9
申请日：2022-04-27
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用，包括成套DNA探针，所述成套DNA探针包括SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：360所示的DNA探针。本发明是可以检测90基因的试剂盒（Panel产品），可一次性对目前已经被美国食品药品监督管理局（FDA）/国家药品监督管理局（NMPA）批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本，进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读，从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。
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公开(公告)号：CN114525344A
公开(公告)日：2022-05-24
申请号：CN202210426612.1
申请日：2022-04-22
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 一种用于检测或辅助检测肿瘤相关基因变异的试剂盒及其应用，包括成套DNA探针，所述成套DNA探针包括SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：320所示的DNA探针。本发明是可以检测80基因的试剂盒（Panel产品），可一次性对目前已经美国食品药品监督管理局（FDA）/国家药品监督管理局（NMPA）批准上市的实体瘤靶向药物或免疫检查点抑制剂所对应的生物标志物进行检测。通过采集受检者的肿瘤组织样本及全血样本，进行肿瘤含量评估、DNA提取、建库、捕获、测序、生物信息学分析、医学解读，从而找到可用于指导精准治疗的生物标志物。
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公开(公告)号：CN114373550A
公开(公告)日：2022-04-19
申请号：CN202210275508.7
申请日：2022-03-21
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于分子结构及基因表达的药物IC50深度学习模型预测方法，包括：建立预测药物在不同细胞系中的IC50的深度学习模型；基于深度学习模型进行药物在不同细胞系中的IC50的预测。还公开了预测系统、电子设备及计算机可读存储介质，使用语法变异自动编码器编码药物的化学分子式与使用变异自动编码器编码细胞系表达数据，通过神经网络的方法预测药物在不同细胞系中的IC50，可以直接通过药物的分子信息，预测出药物在不同种类癌症细胞系中IC50的值，可以一定程度上减少临床前开发的资金与时间投入。将模型运用在患者中，可以帮助筛选出药物的适用人群，减少不必要的临床实验，进而提高临床实验的成功率。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113699232A
公开(公告)日：2021-11-26
申请号：CN202011357645.2
申请日：2020-11-26
Applicant: 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 普瑞基准科技(北京)有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种早期诊断胆囊癌的试剂盒及其应用，所述试剂盒包括：CTNNB1突变检测试剂和ARID2突变检测试剂。本发明确定衰老是促成累积的突变的主要因素以及这些肿瘤中CTNNB1和ARID2突变，特别是CTNNB1突变起到关键作用。本发明通过重构胆囊癌转化和癌变演变轨迹的理解，为胆囊癌的早期诊断和有效治疗奠定了基础。
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公开(公告)号：CN116312781B
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202310558775.X
申请日：2023-05-17
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于机器学习的基因组不稳定性评估方法及系统，方法包括：采集并接收生物样本，对生物样本进行处理获得基因组样本；将基因组样本分为训练集和验证集，基于训练集和验证集进行建模获得基因组不稳定性评估模型；基于多个HRR基因形成的基因集合形成建模标准，对基因组不稳定性评估模型进行训练；基于多个基因组不稳定指标对基因组不稳定性进行评估。本发明采用更加复杂精准的机器学习模型算法代替原有直接相加算法；建模标准包括BRCA1/2和其他在突变率、与基因组不稳定性的关联、与药物疗效的关联方面具有良好性能从而可纳入的HRR基因；从而通过精准的机器学习建模方法获得更好的基因组不稳定性分析和评估效果。
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公开(公告)号：CN116453593A
公开(公告)日：2023-07-18
申请号：CN202310691969.7
申请日：2023-06-12
Applicant: 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: G16B25/00
Abstract: 本发明公开了一种细胞状态特征分值的获取方法、装置和电子设备，属于生物信息技术领域。获取方法包括：确定第一细胞状态表征基因，并根据所述第一细胞状态表征基因计算优化前细胞状态特征分值；基于优化前细胞状态特征分值将细胞划分为正向细胞状态类群和负向细胞状态类群；基于正向细胞状态类群和负向细胞状态类群之间的差异表达基因，筛选得到正向细胞状态特征基因；将所述第一细胞状态表征基因和正向细胞状态特征基因融合得到第二细胞状态表征基因，并根据所述第二细胞状态表征基因计算优化后细胞状态特征分值。本发明提高了细胞状态特征分值的可推广性，同时提高了细胞状态特征分值计算的准确性。
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公开(公告)号：CN115019881A
公开(公告)日：2022-09-06
申请号：CN202210830132.1
申请日：2022-07-15
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开了基于基因蛋白活性的小分子抗肿瘤效果鉴定方法及系统。方法包括：基于肿瘤细胞的基因表达数据，获取关键节点基因和从属基因，关键节点基因与多个从属基因存在相关关系，从属基因用于反映关键节点基因的蛋白活性；计算关键节点基因在小分子干扰前后的蛋白活性，获得对应小分子干扰前的蛋白活性的关键节点基因的蛋白活性静态图谱和小分子干扰后的蛋白活性的关键节点基因的蛋白活性变化图谱；比较变化图谱和静态图谱，基于Fisher精确性检验和多重检验校正确定小分子是否可以逆转肿瘤细胞的生理状态，并判断小分子对静态图谱的逆转效果及小分子的抗肿瘤效果，提高了推断小分子抗肿瘤效果的准确性与敏感性。
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公开(公告)号：CN114438218B
公开(公告)日：2022-08-09
申请号：CN202210339492.1
申请日：2022-04-01
Applicant: 普瑞基准科技(北京)有限公司 , 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司 , 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/12
Abstract: 本发明公开了一种检测多种肿瘤的基因Panel、试剂盒及应用。基因Panel包括遗传性乳腺癌卵巢癌综合征BRCA相关基因、林奇综合征相关基因、其他与所述多种肿瘤相关的基因和同源重组修复通路关键基因。可针对遗传性乳腺癌卵巢癌综合征BRCA相关基因、林奇综合征相关基因、其他与所述多种肿瘤相关的基因和同源重组修复通路关键基因进行胚系水平或合并肿瘤组织水平的检测，并根据检测结果准确评估这些基因与妇科肿瘤、乳腺癌、前列腺癌及消化道肿瘤相关的遗传风险，指导肿瘤患者有关铂类化疗药及PARP抑制剂的适用情况。通过一次检测实现对妇科肿瘤、乳腺癌、前列腺癌及消化道肿瘤等多种肿瘤精准治疗的全面指导。
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