一种基于快速网络嵌入的疾病基因预测方法

    公开(公告)号:CN111540405B

    公开(公告)日:2023-07-07

    申请号:CN202010356861.9

    申请日:2020-04-29

    Applicant: 新疆大学

    Abstract: 本发明公开了疾病基因预测技术领域,具体领域为一种基于快速网络嵌入的疾病基因预测方法,可以更有效地利用多种关联数据中的信息来预测疾病相关基因。其方法由四部分组成:(1)利用疾病‑基因、疾病‑表型、蛋白质‑蛋白质、基因‑GO关联等多种类型的关联数据构建异构网络;(2)采用快速网络嵌入方法提取疾病和基因的低维矢量表示;(3)使用低维矢量表示构建由疾病和基因组成的双层异构网络;(4)将异构网络传播应用于网络预测疾病相关基因。本方法有提高疾病基因预测能力方面的重要作用,并通过与最新算法的比较验证了本方法的优越性能。

    一种基于快速网络嵌入的疾病基因预测方法

    公开(公告)号:CN111540405A

    公开(公告)日:2020-08-14

    申请号:CN202010356861.9

    申请日:2020-04-29

    Applicant: 新疆大学

    Abstract: 本发明公开了疾病基因预测技术领域,具体领域为一种基于快速网络嵌入的疾病基因预测方法,可以更有效地利用多种关联数据中的信息来预测疾病相关基因。其方法由四部分组成:(1)利用疾病-基因、疾病-表型、蛋白质-蛋白质、基因-GO关联等多种类型的关联数据构建异构网络;(2)采用快速网络嵌入方法提取疾病和基因的低维矢量表示;(3)使用低维矢量表示构建由疾病和基因组成的双层异构网络;(4)将异构网络传播应用于网络预测疾病相关基因。本方法有提高疾病基因预测能力方面的重要作用,并通过与最新算法的比较验证了本方法的优越性能。

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