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公开(公告)号：CN112522424B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202011502063.9
申请日：2020-12-18
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种利用猪TLR6基因ERV插入多态提高仔猪天然免疫力的分子标记及其育种方法，涉及分子遗传学领域。192bp的ERV插入后TLR6基因的启动子活性显著升高，且天然免疫相关的TLR信号通路中的TLR6、TLR1、下游的MyD88，Rac1，TOLLip，TIRAP及细胞因子IL‑6，IL‑8和TNFα基因在30日龄仔猪重要免疫器官中的表达及血液中IL‑6和TNFα因子水平升高。可见通过检测猪TLR6基因的192bpERV插入多态可以作为提高仔猪天然免疫力的分子标记，不仅方法简便快速，而且不受环境影响，可实现早期选种选配。
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公开(公告)号：CN116790762A
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202310511883.1
申请日：2023-05-09
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/12 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物遗传育种领域，公开了与猪生长性状相关的两个基因3’UTR区SINE逆转座子插入多态分子标记、检测方法及应用；SPATA17‑SINERIP1和FGL1‑SINERIP1的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示；SPATA17‑SINERIP1标记纯合无插入基因型SINE‑/‑的个体背膘厚高于SINE+/+和SINE+/‑个体；FGL1‑SINERIP1标记纯合有插入基因型SINE+/+个体的三十公斤体重日龄高于SINE‑/‑和SINE+/‑个体；本发明的两个SINE转座子多态分子标记可用于猪个体的早期选择，在选配中提供分子依据，有助于提高选育效率。
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公开(公告)号：CN116590425A
公开(公告)日：2023-08-15
申请号：CN202310433591.0
申请日：2023-04-21
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物遗传育种领域，公开了一种与猪背膘厚关联的CA5B基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自CA5B基因，该序列的257到586位点之间是一个测序发现的330bp反向SINE转座子的插入多态性位点，该位点表现为SINE+/+、SINE+/‑或SINE‑/‑三种基因型，纯合插入基因型(SINE+/+)的个体背膘厚显著高于纯合无插入基因型(SINE‑/‑)的个体。本发明的CA5B基因内SINE转座子多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，也可在选配中提供分子依据。
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公开(公告)号：CN112094923B
公开(公告)日：2022-07-12
申请号：CN202011057170.5
申请日：2020-09-30
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物遗传育种领域和分子标记选育领域，公开了一个与猪生长速度关联的LEPROT基因内的SINE转座子多态分子标记检测方法及应用。本发明的方法是检测待测猪的LEPROT基因的第一内含子区是否存在一个276bp的SINE转座子反向插入多态标记，该分子标记显著影响猪的100kg体重日龄的性状。本发明还提供了一种用于鉴定该分子标记位点的引物对，利用该分子标记和引物对可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于种猪生长速度性状遗传改良中，可以提高生产效益。
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公开(公告)号：CN112159822A
公开(公告)日：2021-01-01
申请号：CN202011061777.0
申请日：2020-09-30
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体涉及一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体及其介导的定点整合方法，本发明通过DNA重组技术，制成转座酶和切割缺陷型Cas酶(dCpf1)的融合表达系统，该系统表达的融合蛋白与转座子介导的基因片段、crRNA形成的复合物在crRNA引导下与靶位点特异性结合，在靶位点进行定点整合，从而可以实现基因大片段高效定点整合，同时该技术由于去除了CRISPR系统基因切割功能，避免了脱靶效应的产生。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111876490A
公开(公告)日：2020-11-03
申请号：CN202010629476.7
申请日：2020-07-03
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明为猪育种与猪的分子标记辅助选择领域，具体涉及一种提高猪生长速度的连锁分子标记、其检测方法及应用，所述分子标记为IGFBP3基因5'侧翼区存在逆转录转座子SINE或LINE的插入。本发明可快速检测基因型选择具有优良生长性状的个体，可有效提高生产效益。
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公开(公告)号：CN116837106A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310562039.1
申请日：2023-05-18
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与猪生长性状关联的逆转录病毒转座子插入多态分子标记、检测方法及应用，属于动物遗传育种领域，AEMK02000197.1:13336‑22596（SEQ ID NO:1）标记逆转录病毒+/+的个体达到30kg的日龄和100kg的日龄显著小于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；chr9:138895584‑138904839（SEQ ID NO:2）标记逆转录病毒+/+的个体达到100kg的日龄显著大于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；本发明的全长逆转录病毒多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，对生长性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。
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公开(公告)号：CN111876490B
公开(公告)日：2022-07-15
申请号：CN202010629476.7
申请日：2020-07-03
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明为猪育种与猪的分子标记辅助选择领域，具体涉及一种提高猪生长速度的连锁分子标记、其检测方法及应用，所述分子标记为IGFBP3基因5'侧翼区存在逆转录转座子SINE或LINE的插入。本发明可快速检测基因型选择具有优良生长性状的个体，可有效提高生产效益。
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公开(公告)号：CN108179198B
公开(公告)日：2020-02-07
申请号：CN201810068583.X
申请日：2018-01-24
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及一种基于LINE1转座子与微卫星引物相结合的猪基因组分子标记挖掘方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列设计特异性引物；同时根据生物信息学分析获得的猪的基因组中分布较广泛的微卫星序列设计微卫星引物；两种引物结合，以不同品种猪的基因组为模板扩增；筛选比较清晰、多态性高，重复性好的扩增条带，克隆测序；将测序结果比对分析，设计旁侧特异性引物与反转录转座子LINE1特异性引物组合，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增多个品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。
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公开(公告)号：CN110157811A
公开(公告)日：2019-08-23
申请号：CN201910409360.X
申请日：2019-05-16
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与猪背膘厚关联的GHR基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自GHR基因，该序列的200到493位点存在一个反向SINE转座子的插入多态性位点，该位点表现为SINE+/+、SINE+/-或SINE-/-三种基因型，纯合插入基因型（SINE+/+）的个体背膘厚显著小于纯合无插入基因型（SINE-/-）的个体。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，也可在选配中提供分子依据。将会对背膘性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记为筛选猪的背膘厚提供了新的方法。
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