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公开(公告)号：CN110257481B
公开(公告)日：2023-07-28
申请号：CN201910384029.7
申请日：2019-05-09
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6809
Abstract: 本发明公开了一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法，包括以下步骤：（1）选取目标基因或待研究的基因组片段为参考序列。（2）将参考序列在NCBI的WGS数据库中猪的基因组测序数据进行Blast比对，获取不同品种基因组中的同源序列，并对上述序列进行手动校对和拼接。（3）根据猪转座子数据对参考序列和拼接序列进行转座子注释以及多序列比对。（4）挑选序列间存在的超过100个碱基且对应转座子的Indel位点，作为候选TIP位点。（5）以不同品种的池DNA为模板进行PCR扩增检测，选取带型清楚且存在多态性的TIP位点。该方法可以迅速找到目标区域或基因中便于检测、结果清晰易判断的分子标记。
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公开(公告)号：CN107460254B
公开(公告)日：2020-02-14
申请号：CN201710928978.8
申请日：2017-10-09
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及分子生物学和生物信息学领域，具体涉及一种基于猪LINE1转座子插入多态性研发新型分子标记的方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列作为查询序列，在猪公开的基因组寻找插入位点；对寻找到的LINE1的每个插入位点，分别向上、下游延伸300‑500个核苷酸序列，然后下载每条序列；获得的序列去除冗余；根据获得的序列信息设计检测引物，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增不同品种，或同一品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明方法可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。
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公开(公告)号：CN101285102A
公开(公告)日：2008-10-15
申请号：CN200810098906.6
申请日：2008-05-16
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明公开了一种猪精囊腺生物反应器表达特性研究的检测体系。技术方案利用构建的猪精囊腺生物反应器表达元件，在小鼠体内进行暂态表达，进行猪精囊腺生物反应器转基因构件的表达水平、组织特异性、表达产物活性研究，为真正的转基因猪精囊腺生物反应器研究提供实验依据。与同类技术相比，该发明具有经济、快速、实用的特点。
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公开(公告)号：CN101279097A
公开(公告)日：2008-10-08
申请号：CN200810123602.0
申请日：2008-05-22
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明公开了一种基因免疫方法。所说的方法是以常规方法克隆目标基因cDNA，然后构建含目标抗原cDNA的真核表达载体重组质粒，以转座酶质粒作为免疫佐剂；将真核表达载体重组质粒和转座酶质粒按4∶1混匀，然后用基因包裹剂PEI按PEI∶质粒＝2∶1包裹，按每克体重注射1微克质粒的剂量为进行动物免疫。该方法能显著促进抗体效价的提高，建立了一种简单、经济、实用、高效的抗体制备方法，可以进行多种商业化抗体的生产。
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公开(公告)号：CN116837106A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310562039.1
申请日：2023-05-18
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与猪生长性状关联的逆转录病毒转座子插入多态分子标记、检测方法及应用，属于动物遗传育种领域，AEMK02000197.1:13336‑22596（SEQ ID NO:1）标记逆转录病毒+/+的个体达到30kg的日龄和100kg的日龄显著小于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；chr9:138895584‑138904839（SEQ ID NO:2）标记逆转录病毒+/+的个体达到100kg的日龄显著大于逆转录病毒+/‑和逆转录病毒‑/‑个体；本发明的全长逆转录病毒多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，对生长性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111876490B
公开(公告)日：2022-07-15
申请号：CN202010629476.7
申请日：2020-07-03
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明为猪育种与猪的分子标记辅助选择领域，具体涉及一种提高猪生长速度的连锁分子标记、其检测方法及应用，所述分子标记为IGFBP3基因5'侧翼区存在逆转录转座子SINE或LINE的插入。本发明可快速检测基因型选择具有优良生长性状的个体，可有效提高生产效益。
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公开(公告)号：CN108179198B
公开(公告)日：2020-02-07
申请号：CN201810068583.X
申请日：2018-01-24
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及一种基于LINE1转座子与微卫星引物相结合的猪基因组分子标记挖掘方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列设计特异性引物；同时根据生物信息学分析获得的猪的基因组中分布较广泛的微卫星序列设计微卫星引物；两种引物结合，以不同品种猪的基因组为模板扩增；筛选比较清晰、多态性高，重复性好的扩增条带，克隆测序；将测序结果比对分析，设计旁侧特异性引物与反转录转座子LINE1特异性引物组合，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增多个品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。
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公开(公告)号：CN110157811A
公开(公告)日：2019-08-23
申请号：CN201910409360.X
申请日：2019-05-16
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与猪背膘厚关联的GHR基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自GHR基因，该序列的200到493位点存在一个反向SINE转座子的插入多态性位点，该位点表现为SINE+/+、SINE+/-或SINE-/-三种基因型，纯合插入基因型（SINE+/+）的个体背膘厚显著小于纯合无插入基因型（SINE-/-）的个体。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，也可在选配中提供分子依据。将会对背膘性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记为筛选猪的背膘厚提供了新的方法。
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公开(公告)号：CN107460254A
公开(公告)日：2017-12-12
申请号：CN201710928978.8
申请日：2017-10-09
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明涉及分子生物学和生物信息学领域，具体涉及一种基于猪LINE1转座子插入多态性研发新型分子标记的方法。该方法是利用LINE1的5’端核苷酸序列或3’端核苷酸序列作为查询序列，在猪公开的基因组寻找插入位点；对寻找到的LINE1的每个插入位点，分别向上、下游延伸300-500个核苷酸序列，然后下载每条序列；获得的序列去除冗余；根据获得的序列信息设计检测引物，再利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增不同品种，或同一品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明方法可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。
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公开(公告)号：CN112522424B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202011502063.9
申请日：2020-12-18
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种利用猪TLR6基因ERV插入多态提高仔猪天然免疫力的分子标记及其育种方法，涉及分子遗传学领域。192bp的ERV插入后TLR6基因的启动子活性显著升高，且天然免疫相关的TLR信号通路中的TLR6、TLR1、下游的MyD88，Rac1，TOLLip，TIRAP及细胞因子IL‑6，IL‑8和TNFα基因在30日龄仔猪重要免疫器官中的表达及血液中IL‑6和TNFα因子水平升高。可见通过检测猪TLR6基因的192bpERV插入多态可以作为提高仔猪天然免疫力的分子标记，不仅方法简便快速，而且不受环境影响，可实现早期选种选配。
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