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公开(公告)号：CN117344010B
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202210762763.4
申请日：2022-06-29
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于诊断胃癌的DNA甲基化生物标记物、试剂盒及用途。本发明提供了一种用于诊断胃癌的甲基化生物标记物，其中，所述的甲基化生物标记物包含等同于和/或互补于SEQ ID NO：1～42所示的靶序列中的至少一种、长度至少为15个寡核苷酸的片段，并且所述寡核苷酸的片段包含至少一个CG指示的甲基化位点。通过本发明提供的多基因甲基化联合检测的组合具有更佳的判别性能。本发明提供了对多个甲基化区域检测的试剂盒，其中的引物对及探针的设计及其组合方法对于同时并行检测多个甲基化区域的甲基化程度至关重要。本发明还为无创检测肿瘤疾病尤其是胃癌提供了一种快速有效地诊断和分级的手段。
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公开(公告)号：CN117393057A
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN202210760372.9
申请日：2022-06-29
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
Abstract: 本公开涉及一种分类方法及装置、电子设备和存储介质，所述方法包括：从甲基化特异性扩增测序的测序样本数据中提取各个目标扩增区域中的各种甲基化模式的扩增子数目以及各个内参扩增区域的扩增子数目；从各个内参扩增区域中确定至少一个目标内参扩增区域，并对各个目标扩增区域的扩增子数目进行标准化处理；根据各个测序样本数据中各个目标扩增区域的各个甲基化模式的扩增子数目的占比，计算各个目标扩增区域的平均熵；将前述得到的数据输入到分类模型中，快速、准确地得到该测序样本数据的分类结果。提高癌症早筛分类预测的正确率、敏感度和特异性。
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公开(公告)号：CN117344010A
公开(公告)日：2024-01-05
申请号：CN202210762763.4
申请日：2022-06-29
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于诊断胃癌的DNA甲基化生物标记物、试剂盒及用途。本发明提供了一种用于诊断胃癌的甲基化生物标记物，其中，所述的甲基化生物标记物包含等同于和/或互补于SEQ ID NO：1～42所示的靶序列中的至少一种、长度至少为15个寡核苷酸的片段，并且所述寡核苷酸的片段包含至少一个CG指示的甲基化位点。通过本发明提供的多基因甲基化联合检测的组合具有更佳的判别性能。本发明提供了对多个甲基化区域检测的试剂盒，其中的引物对及探针的设计及其组合方法对于同时并行检测多个甲基化区域的甲基化程度至关重要。本发明还为无创检测肿瘤疾病尤其是胃癌提供了一种快速有效地诊断和分级的手段。
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公开(公告)号：CN114277135B
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202111241138.7
申请日：2021-10-25
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种可用于胃癌淋巴结转移检测的DNA甲基化分子标记物或其组合，所述DNA甲基化分子标记物包括选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.13所示序列或其完全互补序列中的任意一种或两种以上的组合。本发明还提供了上述甲基化分子标记物或其组合的检测试剂盒，以及检测方法。本发明所述DNA甲基化分子标记物或其组合，通过检测其共甲基化程度，具有作为判断胃癌淋巴结转移目标的良好前景，能够较灵敏及特异地反映胃癌淋巴结转移的发生，避免了影像学检查中涉及的观测判读结果的主观性，提高了准确率。
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公开(公告)号：CN113637746B
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202010346298.7
申请日：2020-04-27
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于检测肺结节良恶性的DNA甲基化分子标记物，所述DNA甲基化分子标记物为选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.21所示序列或其全长的至少55％的连续片段中的任意一种或两种以上的组合；或为选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.21所示序列的完全互补序列或其全长的至少55％的连续片段中的任意一种或两种以上的组合，本发明还提供了上述DNA甲基化分子标记物的检测试剂盒和检测方法。所述DNA甲基化分子标记物与肺癌高度相关，尤其是组合使用，可以进一步提高对肺结节良恶性的检测的灵敏度和特异性，提高恶性肺结节的检出率，降低检出的假阳性率。所述试剂盒中的引物和探针克服了多个引物和探针在进行多重PCR扩增和检测时存在相互干扰的缺点，定量性能与单个区域定量等同。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114645087A
公开(公告)日：2022-06-21
申请号：CN202111509796.X
申请日：2021-12-10
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于检测肺结节良恶性的DNA甲基化分子标记物或其组合，所述DNA甲基化分子标记物或其组合为选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.19所示序列或其全长的至少55％的连续片段中的任意一种或两种以上的组合；或为选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.19所示序列的完全互补序列或其全长的至少55％的连续片段中的任意一种或两种以上的组合。其中特别是其中的SEQ ID NO.9具有对肺结节良恶性检测的较高特异性。本发明还提供了上述DNA甲基化分子标记物的检测试剂盒和检测方法。所述DNA甲基化分子标记物与肺癌高度相关，尤其是组合使用，可以进一步提高对肺结节良恶性的检测的灵敏度和特异性，提高恶性肺结节的检出率，降低检出的假阳性率。所述试剂盒中的引物和探针克服了多个引物和探针在进行多重PCR扩增和检测时存在相互干扰的缺点，定量性能与单个区域定量等同。
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公开(公告)号：CN114277135A
公开(公告)日：2022-04-05
申请号：CN202111241138.7
申请日：2021-10-25
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种可用于胃癌淋巴结转移检测的DNA甲基化分子标记物或其组合，所述DNA甲基化分子标记物包括选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.13所示序列或其完全互补序列中的任意一种或两种以上的组合。本发明还提供了上述甲基化分子标记物或其组合的检测试剂盒，以及检测方法。本发明所述DNA甲基化分子标记物或其组合，通过检测其共甲基化程度，具有作为判断胃癌淋巴结转移目标的良好前景，能够较灵敏及特异地反映胃癌淋巴结转移的发生，避免了影像学检查中涉及的观测判读结果的主观性，提高了准确率。
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公开(公告)号：CN110872631B
公开(公告)日：2021-08-10
申请号：CN201911367385.4
申请日：2019-12-26
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种用于膀胱癌检测的DNA甲基化标志物组合，其选自SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.22中的任意两种或两种以上的组合，或选自SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.22的完全互补的序列的任意两种或两种以上的组合。本发明还涉及对上述甲基化标志物组合的检测试剂盒。本发明利用多个特异性甲基化区域的共甲基化状态的组合对膀胱癌的发生进行判别和分析，该特异性甲基化组合对于判别膀胱癌的发生灵敏度高，检测方法简便可行。本试剂盒的引物对组合在引物序列设计上克服了单个甲基化位点检测错配造成假阳性的缺点，并考虑了多个甲基化生物标记物引物及探针对组合之间的相互作用。
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公开(公告)号：CN112538529A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN201911114321.3
申请日：2019-11-14
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种可用于检测结直肠癌的分子标记物以及试剂盒和检测方法，所述试剂盒包括有检测20种基因中的至少一种基因甲基化的引物和探针，即针对分子标记物ST8SIA4、ZNF132、TAF3、Twist1、VAV3‑AS1、FBN1、C9orf50、SFMBT2、KCNQ5、FAM72C、ITGA4、KCNJ12、THBD、ZNF304、EVC、S1PR1、ZFHX4‑AS1、EMID1、FAM19A4、NEUROD1各设计了三对引物和三条探针。所述检测方法包括多重PCR再qPCR定量检测。本发明的试剂盒和所述检测方法的灵敏性以及特异性都满足于临床上的需求，对于这多个marker的检测方案来讲，在1期的结直肠癌的诊断取得90％的特异性，同时有83％的灵敏度。
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公开(公告)号：CN112391466A
公开(公告)日：2021-02-23
申请号：CN202010426496.4
申请日：2020-05-19
Applicant: 广州市基准医疗有限责任公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种用于乳腺癌检测的甲基化生物标记物及其组合以及应用，所述于乳腺癌检测的甲基化生物标记物选自26种血浆cfDNA甲基化修饰模式的基因组片段中的至少一种。本发明还涉及了检测上述甲基化生物标记物或其组合的试剂盒。本发明联合分析至少1个基因组片段上的多个甲基化胞嘧啶的共甲基化特征作为判断乳腺癌发病的生物标记物，其准确度远远大于其它血浆生物标记物的检测，并能降低乳腺癌检测中假阳性和假阴性的发生。
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