公开(公告)号：CN109295184A

公开(公告)日：2019-02-01

申请号：CN201810988580.8

申请日：2018-08-28

Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 曾海燕 ,  李程思 ,  吴清平 ,  张菊梅 ,  何文静

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明公开了一种阪崎克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对阪崎克罗诺杆菌的CRISPR1、CRISPR2、CRISPR3和CRISPR6位点序列进行DNA测序，提取四个位点序列中的间隔序列，根据四者的间隔序列组合确定阪崎克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法，无环境污染，对实验室设备及软件要求低，且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息，并可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源，可以推广至食品、检验检疫等领域。

公开(公告)号：CN109295184B

公开(公告)日：2021-06-15

申请号：CN201810988580.8

申请日：2018-08-28

Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 曾海燕 ,  李程思 ,  吴清平 ,  张菊梅 ,  何文静

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明公开了一种阪崎克罗诺杆菌CRISPR分型方法。本方法通过对阪崎克罗诺杆菌的CRISPR1、CRISPR2、CRISPR3和CRISPR6位点序列进行DNA测序，提取四个位点序列中的间隔序列，根据四者的间隔序列组合确定阪崎克罗诺杆菌的CRISPR型别。本发明方法简单、快速、低成本、分辨率高于MLST分型方法，无环境污染，对实验室设备及软件要求低，且CRISPR分子保存有历史侵染的噬菌体及质粒等诸多信息，并可联合数据库实现全国甚至全球标准化分子溯源，可以推广至食品、检验检疫等领域。