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公开(公告)号:CN118398090B
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202410835943.X
申请日:2024-06-26
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 本发明提供了一种基因组注释的方法及电子装置。其中,基因组注释的方法包括S1)将样本基因组序列进行基因结构预测,获得预测基因集;S2)将预测基因集进行BUSCO评估,获得BUSCO评估文件;S3)利用BUSCO评估文件对所述预测基因集进行修正,获得修正基因集;S4)对修正基因集进行基因组注释,获得基因组注释文件;基因结构预测包括转录组预测、从头预测和同源预测。能够解决现有技术中用于基因组注释的预测基因集的完整性差的问题,适用于基因组注释领域。
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公开(公告)号:CN118185922A
公开(公告)日:2024-06-14
申请号:CN202410353518.7
申请日:2024-03-26
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6806
摘要: 本发明公开了一种富集胎儿游离DNA的血浆核酸提取方法,包括:全部游离DNA回收和大片段游离DNA去除。通过在盐离子酸性溶液体系下,使游离DNA与羟基结合部结合获得全部游离DNA和在碱性条件下使含有羧基结合部的液相与结合有游离DNA片段的羟基结合部的固相部分进行混合孵育,去除核酸大片段。从而实现简并血浆游离DNA提取与游离DNA筛选富集流程,以孕妇血浆为样本起始,实现稳定高效的获得胎儿游离DNA占比提升的游离DNA提取产物的目的,并且该方法可根据下游检测需求通过调整核心试剂的比例,选择性地调整(提高)提取产物胎儿游离DNA的富集浓度(即胎儿游离DNA占比),满足不同检测需求。
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公开(公告)号:CN116287161A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202211733841.4
申请日:2022-12-30
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 本发明提供了一种寡核苷酸序列一致性的检测方法,所述方法包括:采用带有待检寡核苷酸序列的引物对对已知DNA序列片段进行扩增,得到扩增产物,对扩增产物直接进行测序,根据测序结果确认待检寡核苷酸的序列一致性。其中,待检额的寡核苷酸序列同时存在于所述的引物对的正/反两条引物序列中,通过已知DNA序列进行测序数据的单链拆分,可以准确、高通量的批量定性分析不同寡核苷酸序列的交叉污染情况和/或合成错误情况。
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公开(公告)号:CN116139962A
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN202211703743.6
申请日:2022-12-29
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: B01L3/02
摘要: 本发明公开了一种液体分装设备和方法及其应用。该设备包括主体,所述主体包括由上至下设置的压板、分液腔以及贯穿于所述分液腔的回放液部件;所述分液腔与所述回放液部件可密闭或可分离,分液腔与回放液部件为密闭时,用于对待分配的液体进行定量分配并存储定量分配的液体;所述压板用于通过施加外力使得分液腔与回放液部件分离,存储的定量分配的液体沿着回放液部件的外壁向下流动并流至移液板。本发明的液体分装设备和方法能够连续高效地对液体进行均分分装,设备造价更低。
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公开(公告)号:CN115148289B
公开(公告)日:2023-01-24
申请号:CN202211081173.1
申请日:2022-09-06
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方法包括:步骤1、将样本的测序数据集与近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对;根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型,得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II,以及无法分型的测序数据集III;步骤2、提取单碱基深度≥1/2平均深度的测序数据集IV;步骤3、将测序数据集I与测序数据集III组装;将测序数据集II与测序数据集III、测序数据集IV组装。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果,可以应用于高度同源的同源四倍体样本,而且花费较低,取样容易。
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公开(公告)号:CN113026113A
公开(公告)日:2021-06-25
申请号:CN201911353778.X
申请日:2019-12-25
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: C40B50/06
摘要: 本发明公开了缓冲液组合物及其应用,其中,该缓冲液组合物包括:通用缓冲液,所述通用缓冲液包括5‑25mMol通用Tris缓冲液、5‑20mMol通用二价阳离子、75‑150mMol通用一价阳离子、0.05‑2质量%表面活性剂和0.5‑2mMol二硫苏糖醇(DTT),pH8‑10;以及连接缓冲液,所述连接缓冲液包括33‑66mM连接Tris缓冲液,0.5‑5mM连接二价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15%PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP,pH值为7‑9。由此,该缓冲液组合物能用于多样本的文库构建,并且,反应时间短,转化率高,错配率低。
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公开(公告)号:CN111968706A
公开(公告)日:2020-11-20
申请号:CN202011121158.6
申请日:2020-10-20
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/20
摘要: 本发明提供一种获得目标样本的目标测序数据的方法,其包括:对第一样本进行第一测序,得到第一样本的第一序列集;对第二样本进行第一测序,得到第二样本的第一序列集;对第二样本进行第二测序,得到第二样本的第二序列集;采用第一样本的第一序列集对第二样本的第二序列集进行筛选,获得第一样本的第二序列集;所述第一样本为目标样本,所述第一样本的第二序列集为目标样本的目标测序数据。
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公开(公告)号:CN110659252A
公开(公告)日:2020-01-07
申请号:CN201910739964.0
申请日:2019-08-12
摘要: 公开了一种基于云的生物信息数据交付方法、装置和电子设备。该基于云的生物信息数据交付方法包括:获取生物信息数据;将所述生物信息数据进行拆分以获得待上传的生物信息数据;以及,将所述待上传的生物信息数据上传到云平台,所述云平台上存储的所述生物信息数据用于通过响应于用户的请求由用户访问和/或下载而交付给用户。这样,提高了数据交付的便利度和安全性,并降低了数据交付的成本。
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公开(公告)号:CN118380052B
公开(公告)日:2024-09-17
申请号:CN202410818231.7
申请日:2024-06-24
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 本发明提供了一种基因组结构预测的方法及电子装置,该基因组结构预测的方法包括:S1)对多个样本的转录组测序序列进行组装,获得转录本组装序列;S2)将转录本组装序列与样本参考基因组序列进行比对,获得比对基因组序列;S3)将比对基因组序列进行基因组结构预测,获得基因组结构预测文件。能够解决现有技术中基因组结构预测文件的完整性差问题,适用于基因组结构预测领域。
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公开(公告)号:CN118380052A
公开(公告)日:2024-07-23
申请号:CN202410818231.7
申请日:2024-06-24
申请人: 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 本发明提供了一种基因组结构预测的方法及电子装置,该基因组结构预测的方法包括:S1)对多个样本的转录组测序序列进行组装,获得转录本组装序列;S2)将转录本组装序列与样本参考基因组序列进行比对,获得比对基因组序列;S3)将比对基因组序列进行基因组结构预测,获得基因组结构预测文件。能够解决现有技术中基因组结构预测文件的完整性差问题,适用于基因组结构预测领域。
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