公开(公告)号：CN118460779A

公开(公告)日：2024-08-09

申请号：CN202410672172.7

申请日：2024-05-28

Applicant: 安徽农业大学

Inventor： 蔡永萍 ,  冯晓锋 ,  吴先昂 ,  洪檟毅 ,  魏鹏程 ,  樊洪泓 ,  刘林

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明提供了一种基于全基因组DNA甲基化和转录组联合分析筛选梨果实石细胞发育差异基因的方法：S1、提取“石细胞含量高”和“石细胞含量低”的两个梨品种果实总DNA和总RNA；S2、DNA甲基化检测与转录组测序；S3、对DNA甲基化测序结果分析，筛选具有差异甲基化区DMR的基因；对转录组测序结果分析，筛选差异表达基因DEG；联合分析，筛选出表达量和DNA甲基化同时存在差异的基因；GO富集和KEGG富集分析。本发明能够通过融合DNA甲基化组数据和转录组数据挖掘目标基因，实现明联合分析甲基组数据和转录组数据，具有更全面的数据结果解释，为深入了解梨的遗传调控网络，为梨分子育种提供新的思路和策略。