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公开(公告)号:CN104182656B
公开(公告)日:2017-06-16
申请号:CN201410395461.3
申请日:2014-08-12
Applicant: 大连海事大学
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明提供了一种在染色体上定位显示生物基因表达信息及环境敏感区域的方法以及系统。该方法包括:下载生物染色体基因组序列;读入相应生物样本基因表达芯片数据后经对照处理、对数处理和归一化处理,得环境条件值;将基因表达芯片数据矩阵中的基因名字与下载的生物染色体基因序列中基因名字相匹配后,将基因的环境条件值定位到生物体基因组序列中对应基因位置上;根据定位的环境条件值,得生物染色体基因组上基因表达图像以及环境敏感区域。本发明实现了表达变化的基因在染色体上的分布特征的可视化功能,可获得环境敏感区域基因的分布特征数据,为在染色体层面上分析基因表达变化敏感区域,推测环境敏感型的转录因子提供有效的帮助。
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公开(公告)号:CN104182656A
公开(公告)日:2014-12-03
申请号:CN201410395461.3
申请日:2014-08-12
Applicant: 大连海事大学
IPC: G06F19/20
Abstract: 本发明提供了一种在染色体上定位显示生物基因表达信息及环境敏感区域的方法以及系统。该方法包括:下载生物染色体基因组序列;读入相应生物样本基因表达芯片数据后经对照处理、对数处理和归一化处理,得环境条件值;将基因表达芯片数据矩阵中的基因名字与下载的生物染色体基因序列中基因名字相匹配后,将基因的环境条件值定位到生物体基因组序列中对应基因位置上;根据定位的环境条件值,得生物染色体基因组上基因表达图像以及环境敏感区域。本发明实现了表达变化的基因在染色体上的分布特征的可视化功能,可获得环境敏感区域基因的分布特征数据,为在染色体层面上分析基因表达变化敏感区域,推测环境敏感型的转录因子提供有效的帮助。
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