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公开(公告)号：CN109584955A
公开(公告)日：2019-04-05
申请号：CN201811429273.2
申请日：2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多种植物基因组识别人类辐射响应生物标志物的方法，包括检索辐射响应的基因本体论(GO)语义关系，获取多种植物中的注释基因及在拟南芥中直系同源基因；计算多种植物每一GO语义在拟南芥中直系同源基因的并集与辐射品质特异性基因集合；经蛋白互作网络分析，获取蛋白连接度大于设置阈值的基因集合；统计基因在多种植物中出现次数，获取基因多样性指数大于设置阈值的基因集合；最后，经基因同源性分析，获取这些基因在人类中的直系同源基因集合，导出人类辐射响应生物标志物。本发明解决了利用植物的基因组筛选新的人类辐射响应生物标志物的问题。在辐射剂量估算、辐射损伤诊断、以及辐射健康风险预警等方面有应用前景。
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公开(公告)号：CN109584955B
公开(公告)日：2022-09-23
申请号：CN201811429273.2
申请日：2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多种植物基因组识别人类辐射响应生物标志物的方法，包括检索辐射响应的基因本体论(GO)语义关系，获取多种植物中的注释基因及在拟南芥中直系同源基因；计算多种植物每一GO语义在拟南芥中直系同源基因的并集与辐射品质特异性基因集合；经蛋白互作网络分析，获取蛋白连接度大于设置阈值的基因集合；统计基因在多种植物中出现次数，获取基因多样性指数大于设置阈值的基因集合；最后，经基因同源性分析，获取这些基因在人类中的直系同源基因集合，导出人类辐射响应生物标志物。本发明解决了利用植物的基因组筛选新的人类辐射响应生物标志物的问题。在辐射剂量估算、辐射损伤诊断、以及辐射健康风险预警等方面有应用前景。
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公开(公告)号：CN109584968B
公开(公告)日：2022-09-23
申请号：CN201811428144.1
申请日：2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法，通过使用生物信息学方法在基因本体论搜索工具，筛选特定生物学过程的语义关系；在不同物种的基因组注释数据库中，筛选被注释到上述语义的不同物种中的基因集合信息；对特定物种的基因集合信息进行同源性分析，筛选其在待研究物种中的直系同源基因；将上述基因与待研究物种中参与该生物学过程的参考基因进行比较分析，筛选特定物种中参与生物学过程调控新基因。本发明基于特定生物学过程在不同的物种之间具有高度保守性的特征，建立了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法，为进一步重构系统的基因调控网络提供支撑作用，这对于疾病早期诊断、个性化治疗、药物研发具有重要意义。
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公开(公告)号：CN109584968A
公开(公告)日：2019-04-05
申请号：CN201811428144.1
申请日：2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法，通过使用生物信息学方法在基因本体论搜索工具，筛选特定生物学过程的语义关系；在不同物种的基因组注释数据库中，筛选被注释到上述语义的不同物种中的基因集合信息；对特定物种的基因集合信息进行同源性分析，筛选其在待研究物种中的直系同源基因；将上述基因与待研究物种中参与该生物学过程的参考基因进行比较分析，筛选特定物种中参与生物学过程调控新基因。本发明基于特定生物学过程在不同的物种之间具有高度保守性的特征，建立了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法，为进一步重构系统的基因调控网络提供支撑作用，这对于疾病早期诊断、个性化治疗、药物研发具有重要意义。
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