公开(公告)号：CN105349617A

公开(公告)日：2016-02-24

申请号：CN201410409210.6

申请日：2014-08-19

Applicant: 复旦大学

Inventor： 郁颖 ,  庆涛 ,  赵琛 ,  杜婷婷 ,  郑媛婷 ,  石乐明

IPC: C12Q1/68 ,  C12M1/34

Abstract: 本发明属于高通量RNA测序技术领域，公开了一种通过加入外源参照物对高通量RNA测序数据进行质量评估和质量控制的方法，其包括：系统评估外源参照序列在测定样品中的比例、定量水平、基因覆盖度及测序错误率等特征，以及评估批次效应并在此基础上优化数据分析方案。本发明还公开了一种对高通量测序进行质量控制的装置，包括：基因表达测算单元、相关性分析单元、基因覆盖度分析单元和碱基错误率分析单元。本发明可以针对RNA质量、转录组测序实验过程及数据分析流程等多个环节进行质量控制，从而大幅提高高通量测序数据的可靠性和可重复性。

公开(公告)号：CN105468451A

公开(公告)日：2016-04-06

申请号：CN201410409376.8

申请日：2014-08-19

Applicant: 复旦大学

Inventor： 赵琛 ,  郁颖 ,  庆涛 ,  石乐明

IPC: G06F9/50 ,  G06F9/48

Abstract: 本发明属计算机领域，涉及一种基于高通量测序数据的计算机集群的作业调度系统。具体涉及针对高通量组学数据的数据密集性计算的集群作业调度系统。本发明中包括：搭建独立的消息与储存网络构架；指定分析软件与输入数据；通过文件系统自动生成指定的分析作业任务；通过消息传递侦听集群计算结点负载状态，向结点布署批量任务；在计算结点里，通过进程通迅侦听任务状态，根据指定负载要求控制任务量，并最终完成批量任务。该作业调度系统与现有技术相比，可以实现以大数据文件为主要输入的高通量组学数据分析的任务自动化，减少结点间的消息通迅，并形成对数据密集型任务的多层次负载平衡，充分利用高速网络资源进行数据传输。