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公开(公告)号：CN113640092A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202010325021.6
申请日：2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种石蜡包埋组织样本的处理方法以及其质谱检测方法。本发明提供了一种处理方法，其包括以下步骤：步骤1：在十二烷基硫酸钠存在下，将石蜡包埋组织样本在裂解液中进行裂解，得到蛋白裂解液；步骤2：将步骤1中蛋白裂解液通过丙酮沉淀，得到蛋白固体；步骤3：在尿素存在下，将步骤2中的蛋白固体在缓冲液中进行溶解，得到蛋白溶液；步骤4：将步骤3得到的蛋白溶液进行FASP酶解和脱盐，得到肽段。本发明的方法可以高得率得获取肽段，且步骤少，通过进一步的质谱检测，即可获取石蜡包埋组织样本中的蛋白和肽段信息。
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公开(公告)号：CN113777178B
公开(公告)日：2025-03-21
申请号：CN202010524284.X
申请日：2020-06-10
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于混合谱图库的蛋白质组学背景库、其构建方法及应用。本发明提供了一种蛋白质组学背景库的构建方法，其包括如下步骤，步骤(1)对多来源样本中分离得到的肽段进行质谱检测，并采集得到蛋白质谱数据；步骤(2)将所述的蛋白质谱数据进行搜库和分析后处理形成蛋白质谱数据库文件，并将其集合得到所述的蛋白质组学背景库；其中，所述的多来源样本是指来自于不同物种或同一物种不同组织、器官、体液的样本。通过多来源样本建立的混合背景库的构建，并将其用于不同样品的高通量、定量准确的DIA技术的蛋白质组学检测方法。
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公开(公告)号：CN113551954A
公开(公告)日：2021-10-26
申请号：CN202010325114.9
申请日：2020-04-23
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种温和还原剂酶解组织样本的酶解方法及其质谱检测方法。本发明提供了一种裂解液，其包括：终浓度为质量分数1‑4％的去污剂；所述的去污剂为脱氧胆酸钠和/或碳酸氢铵；终浓度为5‑20μM的3‑(2‑羧基)膦盐酸盐；终浓度为20‑60mM的5‑氯‑邻氨基苯甲酸；终浓度为50‑200mM的三(羟甲基)氨基甲烷‑盐酸；终浓度为0.1‑2mM的苯甲基磺酰氟；和水。组织样本经本发明的裂解液裂解后，能高得率得到组织蛋白和肽段。
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公开(公告)号：CN113777178A
公开(公告)日：2021-12-10
申请号：CN202010524284.X
申请日：2020-06-10
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明公开了一种基于混合谱图库的蛋白质组学背景库、其构建方法及应用。本发明提供了一种蛋白质组学背景库的构建方法，其包括如下步骤，步骤(1)对多来源样本中分离得到的肽段进行质谱检测，并采集得到蛋白质谱数据；步骤(2)将所述的蛋白质谱数据进行搜库和分析后处理形成蛋白质谱数据库文件，并将其集合得到所述的蛋白质组学背景库；其中，所述的多来源样本是指来自于不同物种或同一物种不同组织、器官、体液的样本。通过多来源样本建立的混合背景库的构建，并将其用于不同样品的高通量、定量准确的DIA技术的蛋白质组学检测方法。
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