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公开(公告)号：CN111564177A
公开(公告)日：2020-08-21
申请号：CN202010443336.0
申请日：2020-05-22
Applicant: 四川大学华西医院
IPC: G16B5/00 , G16B20/30 , G16B40/00 , G16H50/50 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及生物医学领域，公开了一种基于DNA甲基化的早期非小细胞肺癌复发模型构建方法，用以解决目前非小细胞肺癌复发模型对非小细胞肺癌复发预测不合理的问题。本发明针对甲基化位点，搜索并合并其中的相关性高的甲基化位点，形成相应的甲基化区间；再根据甲基化芯片的类型，挑选出能够被芯片探针检测的甲基化位点/区间作为训练数据建立包含1个甲基化区间和8个甲基化位点的甲基化风险得分模型，即为非小细胞肺癌复发模型；所述甲基化风险得分模型具有多个得分阈值，这些得分阈值可将甲基化风险得分模型计算出来的得分对应到高得分组、中得分组、低得分组中的一组。本发明适用于非小细胞肺癌复发预测。
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公开(公告)号：CN111564177B
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202010443336.0
申请日：2020-05-22
Applicant: 四川大学华西医院
IPC: G16B5/00 , G16B20/30 , G16B40/00 , G16H50/50 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及生物医学领域，公开了一种基于DNA甲基化的早期非小细胞肺癌复发模型构建方法，用以解决目前非小细胞肺癌复发模型对非小细胞肺癌复发预测不合理的问题。本发明针对甲基化位点，搜索并合并其中的相关性高的甲基化位点，形成相应的甲基化区间；再根据甲基化芯片的类型，挑选出能够被芯片探针检测的甲基化位点/区间作为训练数据建立包含1个甲基化区间和8个甲基化位点的甲基化风险得分模型，即为非小细胞肺癌复发模型；所述甲基化风险得分模型具有多个得分阈值，这些得分阈值可将甲基化风险得分模型计算出来的得分对应到高得分组、中得分组、低得分组中的一组。本发明适用于非小细胞肺癌复发预测。
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公开(公告)号：CN113436741B
公开(公告)日：2023-02-28
申请号：CN202110806001.5
申请日：2021-07-16
Applicant: 四川大学华西医院
IPC: G16H50/30 , G06Q10/04 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及生物医学领域，公开了一种基于组织特异增强子区域DNA甲基化的肺癌复发预测方法，用以解决目前非小细胞肺癌复发模型对非小细胞肺癌复发预测不合理的问题。本发明首先提取肺癌患者的DNA，并进行DNA甲基化检测，得到组织特异增强子区域的DNA甲基化位点的beta值；其中，DNA甲基化位点包括chr1:170667082、chr12:85280518、chr17:76561412、chr11:9759297、chr15:91915828、chr16:1079990、chr2:226797988、chr7:150477419；然后将DNA甲基化位点的beta值代入预先构建的肺癌复发模型，计算出模型得分，并根据模型得分以及多个得分阈值得到预测结果。本发明适用于早期非小细胞肺癌的复发预测。
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公开(公告)号：CN113436741A
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN202110806001.5
申请日：2021-07-16
Applicant: 四川大学华西医院
IPC: G16H50/30 , G06Q10/04 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及生物医学领域，公开了一种基于组织特异增强子区域DNA甲基化的肺癌复发预测方法，用以解决目前非小细胞肺癌复发模型对非小细胞肺癌复发预测不合理的问题。本发明首先提取肺癌患者的DNA，并进行DNA甲基化检测，得到组织特异增强子区域的DNA甲基化位点的beta值；其中，DNA甲基化位点包括chr1:170667082、chr12:85280518、chr17:76561412、chr11:9759297、chr15:91915828、chr16:1079990、chr2:226797988、chr7:150477419；然后将DNA甲基化位点的beta值代入预先构建的肺癌复发模型，计算出模型得分，并根据模型得分以及多个得分阈值得到预测结果。本发明适用于早期非小细胞肺癌的复发预测。
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