公开(公告)号：CN109903812A

公开(公告)日：2019-06-18

申请号：CN201910133090.4

申请日：2019-02-22

Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)

Inventor： 李君一 ,  张丽 ,  平原 ,  李辉年 ,  许清哲 ,  王荣杰 ,  刘博 ,  王亚东

IPC: G16B25/10 ,  G16B40/10

Abstract: 本发明公开了一种基于信息熵的基因序列数字化实现方法及系统。其中，所述方法包括：输入脱氧核糖核酸DNA序列，设定滑动窗口的长度l及子串长度n，和根据该设定的滑动窗口的长度l，从该输入的脱氧核糖核酸DNA序列的第一个碱基开始，步长为1，和计算该设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给该设定的滑动窗口内的碱基，和重复计算该设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给该设定的滑动窗口内的碱基，直到到达该输入的脱氧核糖核酸DNA序列的最后一个碱基位置，和输出得到同该输入的脱氧核糖核酸DNA序列长度的数字序列。通过上述方式，能够实现预测基因序列中的外显子区域。