父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法

    公开(公告)号:CN114974413A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202210535249.7

    申请日:2022-05-17

    Abstract: 父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法,涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决现有基因关联检测方法还存在难以克服群体分层的影响,从而导致无法实现在家庭型数据框架下基因与性状的关联检测问题。本发明包括:信息获取模块,主成分提取模块,家庭内部相关性统计量构造模块,全部家庭数据关联检测统计量获取模块,基因关联检测模块;信息获取模块用于获取标记位点信息、性状信息;主成分提取模块用于提取信息主成分;家庭内部相关性统计量构造模块用于构造家庭内部相关性统计量;全部家庭数据关联检测统计量获取模块用于取全部家庭数据关联检测统计量;所述基因关联检测模块用于进行基因关联检测。本发明用于基因关联检测。

    基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法

    公开(公告)号:CN115206428A

    公开(公告)日:2022-10-18

    申请号:CN202210802687.5

    申请日:2022-07-07

    Abstract: 基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法,涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决由于近亲亲属对数据获取难度大导致目前的基因连锁关系检测方法并不适用的问题。本发明所述系统包括:极值祖孙对判定模块:用于判定祖孙对类型;极值祖孙对设计模块:用于获取不同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率;遗传连锁检验模块:用于根据同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数判断祖孙对是否存在连锁关系;功效测定模块,用于根据祖孙对的类型和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率获取有连锁关系的祖孙对的检验功效。本发明用于检测基因的连锁关系并获取检验功效。

    基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法

    公开(公告)号:CN115206428B

    公开(公告)日:2023-05-09

    申请号:CN202210802687.5

    申请日:2022-07-07

    Abstract: 基于极值表型祖孙对数据的遗传连锁检验系统及方法,涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决由于近亲亲属对数据获取难度大导致目前的基因连锁关系检测方法并不适用的问题。本发明所述系统包括:极值祖孙对判定模块:用于判定祖孙对类型;极值祖孙对设计模块:用于获取不同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率;遗传连锁检验模块:用于根据同等位基因数目下祖孙对的累积分布函数判断祖孙对是否存在连锁关系;功效测定模块,用于根据祖孙对的类型和祖孙对基因型在不同等位基因数目下的条件概率获取有连锁关系的祖孙对的检验功效。本发明用于检测基因的连锁关系并获取检验功效。

    父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法

    公开(公告)号:CN114974413B

    公开(公告)日:2023-05-05

    申请号:CN202210535249.7

    申请日:2022-05-17

    Abstract: 父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法,涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决现有基因关联检测方法还存在难以克服群体分层的影响,从而导致无法实现在家庭型数据框架下基因与性状的关联检测问题。本发明包括:信息获取模块,主成分提取模块,家庭内部相关性统计量构造模块,全部家庭数据关联检测统计量获取模块,基因关联检测模块;信息获取模块用于获取标记位点信息、性状信息;主成分提取模块用于提取信息主成分;家庭内部相关性统计量构造模块用于构造家庭内部相关性统计量;全部家庭数据关联检测统计量获取模块用于取全部家庭数据关联检测统计量;所述基因关联检测模块用于进行基因关联检测。本发明用于基因关联检测。

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