公开(公告)号：CN119432990A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411881341.4

申请日：2024-12-19

Applicant: 厦门大学

Inventor： 杨朝勇 ,  许依玲 ,  尹坤 ,  余敏 ,  丘宇童 ,  邹宇宁 ,  张惠敏 ,  宋佳

IPC: C12Q1/6869

Abstract: 一种组织切片的空间转录组原位测序方法，涉及基因测序领域，包括：1)原位捕获mRNA；2)逆转录得cDNA；3)去组织保留cDNA；4)cDNA探针杂交；5)原位扩增；6)荧光探针解码测序；7)清洗探针，多轮测序。本发明原位捕获RNA并逆转录为cDNA，实现核酸印迹转移，去除背景干扰，解决RNA降解问题，允许多轮杂交增检测通量。核酸序列共价结合玻片，防信号点移位脱落。用DNA编码挂锁探针识别基因，扩增放大信号，测序解码揭示基因表达。清洗探针后，换探针杂交扩增，提高通量，减少空间拥挤和荧光信号拥挤。

公开(公告)号：CN115386621A

公开(公告)日：2022-11-25

申请号：CN202210705640.7

申请日：2022-06-21

Applicant: 厦门大学

Inventor： 杨朝勇 ,  尹坤 ,  赵美娟 ,  许依玲

IPC: C12Q1/6806 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种测序技术中的文库制备方法，通过对固相微球上的cDNA链进行等温延伸，将微球上的cDNA单链变成双链，然后再以双链为模板进行PCR扩增。由于第二条合成的cDNA链并没有与微球共价连接，只是与第一条cDNA互补，因此，在PCR时95℃的高温变性时，第二条链就会进入溶液相，进行“液‑液”相扩增。由于扩增之前，对微球上的cDNA进行了二链合成，所以经过高温变性，微球的cDNA会同时脱落，进入溶液相进行“液‑液”相扩增，这样就解决了之前扩增时以固相微球上的单链cDNA模板进行扩增导致的扩增偏差问题。本发明可增加文库中cDNA种类的丰富度，增加基因的检出数。