-
公开(公告)号:CN114038509B
公开(公告)日:2024-06-28
申请号:CN202111301560.7
申请日:2021-11-04
Applicant: 厦门大学
Abstract: 一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法,属于分析技术领域。包括步骤:1)对生物样品中的代谢物组进行分析,数据预处理后得到代谢组学数据矩阵;2)构造代谢物‑代谢通路二部图;3)将代谢组学数据矩阵进行代谢物关联网络建模,得到实验组和对照组之间的差异网络;4)计算差异网络在二部图上的富集度;5)基于两组样本间的差异代谢物网络,结合通路数据库的信息,对通路按重要性进行排序,识别潜在扰动通路;6)对潜在扰动通路进行显著性检验,获得显著扰动的代谢通路。利用差异网络的相关理论分析生物机体不同生理状态之间的差异,所筛选出与实验组相关的受扰动代谢通路更为可靠,为理解生物机体背后的发生机制提供新的研究思路。
-
公开(公告)号:CN114038509A
公开(公告)日:2022-02-11
申请号:CN202111301560.7
申请日:2021-11-04
Applicant: 厦门大学
Abstract: 一种基于代谢物关联网络的受扰动通路分析方法,属于分析技术领域。包括步骤:1)对生物样品中的代谢物组进行分析,数据预处理后得到代谢组学数据矩阵;2)构造代谢物‑代谢通路二部图;3)将代谢组学数据矩阵进行代谢物关联网络建模,得到实验组和对照组之间的差异网络;4)计算差异网络在二部图上的富集度;5)基于两组样本间的差异代谢物网络,结合通路数据库的信息,对通路按重要性进行排序,识别潜在扰动通路;6)对潜在扰动通路进行显著性检验,获得显著扰动的代谢通路。利用差异网络的相关理论分析生物机体不同生理状态之间的差异,所筛选出与实验组相关的受扰动代谢通路更为可靠,为理解生物机体背后的发生机制提供新的研究思路。
-