一种基于尿嘧啶引物PCR的基因组步移方法

    公开(公告)号:CN117844910A

    公开(公告)日:2024-04-09

    申请号:CN202311854834.4

    申请日:2023-12-29

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于尿嘧啶引物PCR的基因组步移方法,通过在随机引物(arbitrary walking primer,AWP)3’端的倒数第二个位置引入了尿嘧啶碱基,并在二级UP‑PCR之前,使AWP序列在UNG的作用下被破坏,使得在二级UP‑PCR的热循环中,避免不需要的扩增子被扩增,仅两轮UP‑PCR就足以完成基因组步移任务,并获得足够的扩增特异性,相较传统的热不对称交错PCR、腕表PCR、桥接PCR等基因组步移方法更为简单易行,且具有同等的成功率。

    一种基于尿嘧啶碱基PCR的基因组步移方法

    公开(公告)号:CN118440933A

    公开(公告)日:2024-08-06

    申请号:CN202410409451.4

    申请日:2024-04-07

    Applicant: 南昌大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于尿嘧啶碱基PCR的基因组步移方法,包括:1)在初级PCR中使用dUTP代替dTTP进行扩增;2)对初级PCR产物过柱纯化去除多余的底物、引物和酶;3)然后用初级特异性引物Specific primer,SP和四种正常碱基(A、T、C、G),对纯化产物进行单引物单循环扩增,合成完全由正常碱基组成的单链DNA;4)随后对单引物单循环扩增产物进行UNG处理,破坏含U的DNA,而在单引物单循环扩增中合成的分子则不受影响;5)最后目标单链DNA分子在后续的高严格循环中被特异性引物SP2和AP进行指数扩增得到目的产物。本发明方法能够有效扩增目标DNA分子,抑制非目标产物的扩增,相较传统PCR方法,具有更高的成功率和步移效率。

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