公开(公告)号：CN119147764A

公开(公告)日：2024-12-17

申请号：CN202411189142.7

申请日：2024-08-28

Applicant: 南开大学

Inventor： 李功玉 ,  李若萌 ,  秦伟达 ,  许霞

IPC: G01N33/68 ,  G01N30/02 ,  G01N30/06 ,  G01N30/72 ,  G01N30/86 ,  C12P21/00

Abstract: 本发明公开了一种基于热蛋白组学技术的D‑蛋白质规模化筛选方法，其包括：步骤一、通过向细胞中分别加入蛋白处理剂和不加入蛋白处理剂，得到D‑蛋白质上调组和空白组；步骤二、利用热蛋白质组学技术，获取热稳定性差异蛋白列表；步骤三、利用异构检索技术，获取立体异构蛋白列表；步骤四、将热稳定性差异蛋白列表与立体异构蛋白列表进行比对分析，得潜在D‑蛋白质；步骤五、基于APM酶切技术，获取潜在D‑蛋白质的D位点。本发明通过热蛋白质组学技术实现高通量、高覆盖度的D‑蛋白质的规模化鉴定方法，并能对D‑氨基酸位点进行精确定位，对疾病生物标志物的探寻和重大疾病发病机制探索等均具有重要意义。

公开(公告)号：CN118711659A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410662451.5

申请日：2024-05-27

Applicant: 南开大学

Inventor： 李功玉 ,  许霞 ,  付浩浩 ,  秦伟达

IPC: G16B25/10 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明公开了用于规模化发现D型蛋白质的质谱方法，包括：获得生物样品的构象分辨蛋白组学数据；将构象分辨蛋白组学数据中的氨基酸序列通过搜索蛋白质数据库生成的数据集进行特征提取，建立蛋白质样本异构修饰检索的特征集；对于同一个氨基酸序列的特征数据，删除保留时间差值小于2分钟和/或碰撞横截面积差值小于1.5％的数据，筛选出具有立体异构的蛋白质或多肽，通过计算每一个蛋白质的异构化比例及数量获取初筛结果；利用异构信号放大算法和异构化酶等手段对初筛结果进行异构验证，生成最终的D型蛋白质数据。本发明能够准确地识别蛋白立体异构修饰，提高D型蛋白质规模化识别的可靠性和准确性；快速处理大规模的蛋白质组学数据；具有普适性。