公开(公告)号：CN119400280A

公开(公告)日：2025-02-07

申请号：CN202411371998.6

申请日：2024-09-29

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 吴建盛 ,  郑申申 ,  张航 ,  丁雯

IPC: G16C20/30 ,  G16C20/70 ,  G16C20/90 ,  G16B15/30 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30 ,  G06F18/2321

Abstract: 本发明公开了一种基于结合模式分析的药物分子虚拟筛选方法，属于人工智能药物发现领域；使用PLIP计算待筛选靶标和小分子之间的结合模式，进行编码，并利用DBSCAN算法对结合模式聚类，识别相似结合模式的化合物群体；在筛选阶段，引入两项关键指标：根据氢键补偿数和AutoDock Vina得分形成能量指标，并根据结合模式中相关残基与关键位点alpha碳原子的相关性作为活性指标，用于评估靶标与小分子之间的结合稳定性和特征活性，对候选分子进行多目标前沿分析；本发明方法显著提高了虚拟筛选的效率和精度，增强了对分子间相互作用的细致分析，适用于小规模和大规模的分子筛选，降低药物研发的成本和时间，丰富虚拟筛选结果的多样性，为后续实验提供更具潜力的候选分子。