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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119177290A
公开(公告)日：2024-12-24
申请号：CN202411009050.6
申请日：2024-07-26
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种识别松材线虫纤维素酶多拷贝基因的方法，首先收集来自不同地理位置的松材线虫虫株，提取其DNA并进行高通量测序；利用生物信息学软件分析全基因组信息，得到其CNV(Copy Number Variation)信息以及串联重复序列，结合其功能，筛选出与松材线虫致病相关多拷贝基因——糖苷水解酶45基因(Glycoside hydrolases 45,GH45)，不同拷贝的GH45基因之间对比发现编码区内有串联重复变异存在，通过在TR侧翼序列设计适合的引物，传统的PCR方法即可识别不同TR组合的不同拷贝数，通过PCR和电泳凝胶可以发现大多数单拷贝的虫株来自广东省，这为研究松材线虫致病相关多拷贝基因提供一定的理论基础和数据支撑，也为松材线虫分子标记技术提供了新的研究方向。
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公开(公告)号：CN106982839A
公开(公告)日：2017-07-28
申请号：CN201710433766.2
申请日：2017-06-09
Applicant: 南京林业大学
CPC classification number: A01N43/36
Abstract: 本发明公开了微生物代谢产物灵菌红素在毒杀松材线虫中的应用。与现有技术相比，本发明的灵菌红素的新用途，采用不同的溶剂溶解红色素，通过观察灵菌红素在不同溶剂、不同浓度下对松材线虫的毒杀效果，证实粘质沙雷氏菌代谢产物灵菌红素具有很好的毒杀松材线虫效率，为线虫的生物防治提供了可选择的新的方式。为更好地开发粘质沙雷氏菌的代谢产物灵菌红素的生物活性打下了基础。
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公开(公告)号：CN119101746A
公开(公告)日：2024-12-10
申请号：CN202411140944.9
申请日：2024-08-20
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , G16B30/10
Abstract: 本发明公开了一种识别松材线虫可变剪切的方法，涉及遗传多样性分析技术领域。利用自主参与编写的生物信息学软件分析全基因组信息，在预测可变剪切现象存在的果胶酸裂解酶片段前后200bp左右设计特异性引物，通过PCR扩增产物并纯化。将纯化片段与载体相连的目的片段产物导入大肠杆菌感受态(DH5α)，进行大量复制克隆，而后导入带有氨苄抗生素的LB培养基上过夜生长。挑选带有片段序列的单菌落测序检验序列是否与转录组模板序列一致。测序结果导入到生物信息学分析软件DNAMAN‑Multiple SequenceAlignment进行多序列比对，经类型分析发现，不同虫株含有不同类型的可变剪切。该发明以设计特异性引物为突破点。
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公开(公告)号：CN113096741A
公开(公告)日：2021-07-09
申请号：CN202110414199.2
申请日：2021-04-16
Applicant: 南京林业大学
IPC: G16B40/30 , G16B20/20 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种分析松材线虫种群遗传多样性的方法，先收集来自于不同地理位置的松材线虫虫株，提取其DNA并进行高通量测序；利用自主参与编写的生物信息学软件分析全基因组信息，得到各种SNPs数据及基因型类型，获知松材线虫体内SNPs位点分布情况，进行聚类分析，筛选获得特异性SNP位点。本申请通过聚类分析可将这各虫株分为三类：其中四川省虫株单独聚为A类，广东省有两株虫株分为B类，其余6株虫株分为C类。并且焦磷酸测序结果显示GD位点可将C类虫株与其他两类分开。广东省和四川省松材线虫遗传多样性较高；为推测松材线虫病的传播途径提供了理论基础。
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公开(公告)号：CN106982839B
公开(公告)日：2019-03-15
申请号：CN201710433766.2
申请日：2017-06-09
Applicant: 南京林业大学
Abstract: 本发明公开了微生物代谢产物灵菌红素在毒杀松材线虫中的应用。与现有技术相比，本发明的灵菌红素的新用途，采用不同的溶剂溶解红色素，通过观察灵菌红素在不同溶剂、不同浓度下对松材线虫的毒杀效果，证实粘质沙雷氏菌代谢产物灵菌红素具有很好的毒杀松材线虫效率，为线虫的生物防治提供了可选择的新的方式。为更好地开发粘质沙雷氏菌的代谢产物灵菌红素的生物活性打下了基础。
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