公开(公告)号：CN119152946A

公开(公告)日：2024-12-17

申请号：CN202411490497.X

申请日：2024-10-24

Applicant: 南京大学

Inventor： 王瑾丰 ,  张书博 ,  苏涵 ,  任洪强

IPC: G16B40/00 ,  G06F18/2113 ,  G06F18/25 ,  G06F18/27 ,  G06F18/20

Abstract: 本发明公开了一种基于菌间互作与菌群结构的群落水平量化及评估方法，首先获取微生物群落信息并构建生物关联网络，由显著性分析筛选出高度相关的菌间互作系数；其次计算每个物种的高度相关的菌间互作系数的平均值；接着将物种相对丰度表作为权重与物种平均菌间互作系数矩阵相乘；最后通过两步求和得到群落总关联强度，将其作为新的微生物群落评估指标定义为群落协同指数。该指数越大，意味着群落总正向关联强度越强，微生物群落的稳定性和功能性越好。本发明提供的群落水平量化及评估方法全面涵盖目标群落的菌间互作及菌群结构信息，可实现多维度微生物群落数据向低维的群落水平的量化，能够直观、准确地评估微生物群落整体的功能性和稳定性优劣。