基于全表观组关联分析的植物表观元件挖掘方法及其在植物分子育种中的应用

    公开(公告)号:CN119049552A

    公开(公告)日:2024-11-29

    申请号:CN202411038582.2

    申请日:2024-07-31

    Abstract: 本发明公开了基于全表观组关联分析的植物表观元件挖掘方法及其在植物分子育种中的应用,其中方法通过关联DNA甲基化与数量性状,挖掘不同甲基化自然变异对表型的影响。该方法包括以下步骤:(1)采集种质资源群体材料的表型数据;(2)采集种质资源群体材料的基因组DNA,用于构建重亚硫酸盐文库并测序以获取群体DNA甲基组数据;(3)利用滑动窗口法将基因组分成固定长度的窗口,并根据甲基化水平对窗口分型;(4)使用混合线性模型对窗口的分型与表型数据进行关联分析,确定与表型显著相关的窗口。上述方法可以挖掘负责群体表型变异的表观遗传位点或元件,为植物分子育种提供表观等位基因资源。

    一种水稻OsEIL1基因的RNAi表达载体及其应用

    公开(公告)号:CN118956940A

    公开(公告)日:2024-11-15

    申请号:CN202411110896.9

    申请日:2024-08-14

    Abstract: 本发明公开了一种水稻OsEIL1基因的RNAi表达载体及其应用。通过使水稻OsEIL1基因的RNAi表达载体在水稻中表达,且所述RNAi表达载体能够抑制OsEIL1基因在水稻根部的表达量,即特异抑制OsEIL1基因在水稻根部的表达,进而提高水稻的氮肥利用效率和产量。本发明通过使水稻OsEIL1基因的RNAi表达载体在水稻中表达,使得OsEIL1基因在水稻根部表达量下降,进而提高水稻的氮肥利用效率和产量。试验结果证明:相比OsEIL1基因正常表达的野生型水稻,包含RNAi表达载体的转基因水稻无论在低氮和高氮条件下,地上部生物量、籽粒长度、千粒重和硝酸还原酶活性等均显著增加。同时,相比OsEIL1基因正常表达的野生型水稻,包含RNAi表达载体的转基因水稻在低氮条件下,单株产量增加更多。

    调控水稻氮素吸收能力的基因及其应用

    公开(公告)号:CN118497262A

    公开(公告)日:2024-08-16

    申请号:CN202410761012.X

    申请日:2024-06-13

    Abstract: 本发明公开了一个转录因子基因在调控水稻氮素吸收的应用。基因为OsSPL14,基因为OsSPL14的序列为SEQ ID NO.1,该基因的蛋白序列为SEQ ID NO.2,其位于水稻第8号染色体上。基因OsSPL14在调控水稻氮素吸收中的应用。本发明通过构建OsSPL14转基因载体,获得过表达和敲除植株,对转基因植株体内总氮浓度和15N吸收能力进行测定,发现突变体植株中的总氮浓度和15N吸收能力显著提高,说明OsSPL14基因在水稻氮吸收过程中发挥重要的调控作用。

    基于群体转录组挖掘核心热点基因的方法及其在植物分子育种中的应用

    公开(公告)号:CN119108020A

    公开(公告)日:2024-12-10

    申请号:CN202411078847.1

    申请日:2024-08-07

    Abstract: 本发明公开了基于群体转录组挖掘核心热点基因的方法及其在植物分子育种中的应用,其中方法包括步骤S1:在不同氮条件下对水稻群体进行处理与采样,得到水稻样本。步骤S2:对水稻样本进行差异表达基因分析,得到群体氮响应基因。步骤S3:将群体氮响应基因的表达水平作为分子表型,与遗传变异进行关联分析,得到群体氮响应基因的表达数量性状位点。步骤S4:根据表达数量性状位点筛选出eGWAS热点区域。步骤S5:对群体氮响应基因进行eTWAS分析,得到eTWAS结果。步骤S6:从eTWAS结果中筛选出eTWAS热点基因。步骤S7:将eTWAS热点基因与eGWAS热点区域内的基因取交集,得到核心热点基因。通过eGWAS‑eTWAS联合分析,可以高效且准确地挖掘调控重要生物学途径的核心热点基因。

    调控水稻分蘖、单株产量或氮素吸收能力的基因及其应用

    公开(公告)号:CN118703518A

    公开(公告)日:2024-09-27

    申请号:CN202410761227.1

    申请日:2024-06-13

    Abstract: 本发明涉及植物生长发育分子生物学领域,特别涉及基因OsDLN194的基因工程应用,基因OsDLN194具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,该基因的蛋白序列为SEQ ID NO.2,其位于水稻第7号染色体上。基因OsDLN194在调控水稻分蘖、单株产量和氮素吸收的至少一种性状中的应用。本发明通过克隆基因OsDLN194,构建转基因载体,获得过表达植株,对转基因植株表型性状进行测定,发现过表达植株中分蘖数发生显著变化,相对于野生型水稻来说,过表达植株表现为分蘖数增加,单株产量增加、氮素吸收能力提高等性状,说明OsDLN194基因在水稻分蘖、单株产量和氮素吸收过程中发挥重要的调控功能。

    控制水稻根系伸长和分蘖的基因及其应用

    公开(公告)号:CN116751790A

    公开(公告)日:2023-09-15

    申请号:CN202310790935.3

    申请日:2023-06-30

    Abstract: 本发明涉及植物生长发育分子生物学领域,特别涉及基因OsARF14b及其在控制水稻根系伸长和分蘖中的应用,基因OsARF14b具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,基因OsARF14b在调控水稻根系伸长和分蘖性状中的应用。本发明通过克隆基因OsARF14b,构建转基因载体,获得过表达和敲除转基因材料,对转基因材料表型性状进行统计,发现不同材料中根系长度和分蘖数发生显著变化,与野生型(中花11,ZH11)相比,敲除转基因材料(cas9)的根系长度显著变短、分蘖数显著增加,过表达材料(OE)的根系长度变长、分蘖数显著减少,说明OsARF14b基因在植物根系伸长和分蘖过程中发挥重要的调控功能。

    基因OsMADS5在调控植物根系伸长中的应用

    公开(公告)号:CN116732047A

    公开(公告)日:2023-09-12

    申请号:CN202310510567.2

    申请日:2023-05-08

    Abstract: 本发明涉及植物生长发育分子生物学领域,特别涉及基因OsMADS5在调控植物根系伸长中的应用,基因OsMADS5具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。本发明通过克隆基因OsMADS5,构建转基因载体,获得过表达和敲除转基因材料,对转基因材料表型性状进行测量,得到不同材料中根系长度发生显著变化,与野生型相比,敲除转基因材料根系长度显著增加,过表达材料根系长度变短,说明OsMADS5基因在植物根系伸长过程中发挥重要的调控功能。

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