公开(公告)号：CN118310943A

公开(公告)日：2024-07-09

申请号：CN202410271237.7

申请日：2024-03-11

Applicant: 华中科技大学同济医学院附属同济医院

Inventor： 陈丽婷 ,  张曼 ,  姜利军 ,  金瑾 ,  张义成 ,  肖毅

IPC: G01N15/1433 ,  G06V20/69 ,  C12Q1/02 ,  G01N15/1434 ,  G01N15/1429 ,  G01N21/84 ,  G01N27/62 ,  G01N1/28

Abstract: 本发明提供了肿瘤微环境中的直接细胞邻域在制备CAR‑T治疗患者的预后预测产品中的应用。本申请发明人通过实验发现CD8+T细胞比例较高的细胞邻域(CN1)出现频率与患者长期缓解呈正相关，而肿瘤细胞富集的细胞邻域(CN2)出现频率高则提示患者可能出现短期复发(三个月内)。这些结果表明，在DLBCL肿瘤微环境中，拓扑功能单位(肿瘤微环境中的直接细胞邻域)是CAR‑T治疗后患者预后的一种全新的生物标志物。本申请进一步构建了CAR‑T治疗患者的预后预测系统可以预测CAR‑T治疗患者的预后疗效，准确率高，灵敏度高。

公开(公告)号：CN119296648A

公开(公告)日：2025-01-10

申请号：CN202411173103.8

申请日：2024-08-26

Applicant: 华中科技大学同济医学院附属同济医院

Inventor： 肖敏 ,  向杨 ,  张美兰 ,  沈克锋 ,  吴三云 ,  周涛 ,  张义成

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/2135 ,  G06F18/22 ,  G06F18/27

Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序技术检测KMT2A基因部分串联重复的方法和系统，该方法包括以下步骤：S1：待测样本经NGS实验流程测序完成后得到fastq格式的测序数据，对测序数据进行QC和比对，得到bam格式的比对数据；S2：对数据进行深度计算，使用loess回归对深度进行GC校正，使用PCA方法以预先建立的正常样本基线去除待测样本中的噪音得到最终log‑ratio；S3：使用CBS方法对log‑ratio分段；S4：使用基于MCMC的吉布斯采样对数据进行拟合，计算出KMT2A基因是否存在PTD突变。本发明方法检测灵敏度高，能够在一次panel数据中检测KMT2A‑PTD，联合高通量测序的优势，全方面地评估待测样本诊疗相关基因的变异状态。