一种真菌样本显微成像及智能识别系统及方法

    公开(公告)号:CN110793946A

    公开(公告)日:2020-02-14

    申请号:CN201810863813.1

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G01N21/64

    摘要: 本发明公开了一种真菌样本显微成像及智能识别系统及方法,所述系统包括:显微成像装置、三维移动控制平台及终端;显微成像装置,用于提供显微成像的照明光源并探测待测样本发出的荧光信号,以获取待测样本的真菌显微图像;三维移动控制平台,用于搭载待测样本运动,以实现自动调焦和扫描成像的功能;述终端,用于控制显微成像装置和三维移动控制平台协同工作,并从显微成像装置获取真菌显微图像,并对真菌显微图像进行分析,描绘出真菌显微图像中的菌丝结构轮廓。本发明提供了人工控制平移台运动及拍摄图像的功能,可帮助检验人员对特定区域进行查看,可减少“误报”、“漏报”情况发生,保证检验的准确性。

    基于卷积神经网络的真菌显微图像分割检测方法及系统

    公开(公告)号:CN110796661A

    公开(公告)日:2020-02-14

    申请号:CN201810866451.1

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06T7/10 G06N3/04

    摘要: 本发明公开了一种基于卷积神经网络的真菌显微图像分割检测方法及系统,包括:将若干真菌显微图像分为正样本与负样本,同时对正样本中的菌丝进行标记得到标记后的正样本;将未标记的负样本和标记后的正样本进行切片和样本增强操作,生成可供进行深度学习的训练数据集;构建深度卷积神经网络模型,读取训练数据集生成用于分割检测的分割模型,以采用分割模型识别待检测真菌显微图像中的致病相和非致病相后,用热值图表示全局的真菌显微图像,并且将致病相结构在待检测真菌显微图像中的轮廓描绘出来。通过本发明不仅对真菌显微图像进行分类,而且能够将致病相的菌丝结构从图像中分割并精准定位。

    一种真菌显微图像中致病相的自动识别方法及系统

    公开(公告)号:CN110795965A

    公开(公告)日:2020-02-14

    申请号:CN201810866461.5

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06K9/00 G06K9/62

    摘要: 本发明公开了一种真菌显微图像中致病相的自动识别方法及系统,包括:对各真菌显微图像进行二值化,获得各真菌显微图像的前景图像;提取各前景图像中的菌丝特征和非菌丝特征,获取SVM训练所需的样本数据;使用SVM机器学习算法对所述样本数据进行训练,获取目标识别模型,以利用所述目标识别模型识别待检测真菌显微图像,并标记所述待检测真菌图像中的菌丝。通过本发明能够将致病相的菌丝结构从图像中检测出来并精准定位。

    一种真菌显微图像中致病相的自动识别方法及系统

    公开(公告)号:CN110795965B

    公开(公告)日:2022-05-27

    申请号:CN201810866461.5

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06V20/69 G06V10/77 G06K9/62

    摘要: 本发明公开了一种真菌显微图像中致病相的自动识别方法及系统,包括:对各真菌显微图像进行二值化,获得各真菌显微图像的前景图像;提取各前景图像中的菌丝特征和非菌丝特征,获取SVM训练所需的样本数据;使用SVM机器学习算法对所述样本数据进行训练,获取目标识别模型,以利用所述目标识别模型识别待检测真菌显微图像,并标记所述待检测真菌图像中的菌丝。通过本发明能够将致病相的菌丝结构从图像中检测出来并精准定位。

    基于深度语义分割的真菌显微图像分割检测方法及系统

    公开(公告)号:CN110807754B

    公开(公告)日:2022-05-31

    申请号:CN201810866455.X

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06T7/00 G06T7/10

    摘要: 本发明公开了一种基于深度语义分割的真菌显微图像分割检测方法及系统,所述方法包括:采集N幅真菌显微图像,剔除在所述N幅真菌显微图像中整幅全是黑色背景的图像得到剩余图像,并标注出所述剩余图像中的阳性区域得到标注图像;依据所述标注图像的信息对所述剩余图像和所述标注图像进行切片,生成所需的训练数据集;以残差网络和空洞卷积模块为网络的主体骨架构建深度卷积神经网络模型,读取所述训练数据集训练生成用于分割检测的目标模型,以使用所述目标模型对待检测真菌显微图像进行识别得到所述待检测真菌显微图像的真菌致病相的分割结果。通过本发明能够将致病相的菌丝结构从图像中分割并精准定位。

    基于卷积神经网络的真菌显微图像分割检测方法及系统

    公开(公告)号:CN110796661B

    公开(公告)日:2022-05-31

    申请号:CN201810866451.1

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06T7/10 G06N3/04

    摘要: 本发明公开了一种基于卷积神经网络的真菌显微图像分割检测方法及系统,包括:将若干真菌显微图像分为正样本与负样本,同时对正样本中的菌丝进行标记得到标记后的正样本;将未标记的负样本和标记后的正样本进行切片和样本增强操作,生成可供进行深度学习的训练数据集;构建深度卷积神经网络模型,读取训练数据集生成用于分割检测的分割模型,以采用分割模型识别待检测真菌显微图像中的致病相和非致病相后,用热值图表示全局的真菌显微图像,并且将致病相结构在待检测真菌显微图像中的轮廓描绘出来。通过本发明不仅对真菌显微图像进行分类,而且能够将致病相的菌丝结构从图像中分割并精准定位。

    一种多路扫描与探测的线共聚焦成像装置

    公开(公告)号:CN108519329B

    公开(公告)日:2021-01-15

    申请号:CN201810252673.4

    申请日:2018-03-26

    IPC分类号: G01N21/01

    摘要: 本发明公开了一种多路扫描与探测的线共聚焦成像装置,包括:激发光模块、扫描成像模块以及探测模块;激发光模块用于提供由两束激光束整形得到的两条相互分离的线光斑,激光束的倾斜角和发散角均可调节;扫描成像模块用于将两条线光斑聚焦到不同的成像位置,从而产生两束成像光束,并实现三维扫描成像;探测模块用于实现两路成像光束的分离和探测;通过精细调节激发光模块中两路光束的倾斜角和发散角,可以实现双焦面同时扫描成像或者单物镜视场同一焦面双线同时扫描成像。本发明能够有效提高成像速度,同时便于系统调节。

    基于深度语义分割的真菌显微图像分割检测方法及系统

    公开(公告)号:CN110807754A

    公开(公告)日:2020-02-18

    申请号:CN201810866455.X

    申请日:2018-08-01

    IPC分类号: G06T7/00 G06T7/10

    摘要: 本发明公开了一种基于深度语义分割的真菌显微图像分割检测方法及系统,所述方法包括:采集N幅真菌显微图像,剔除在所述N幅真菌显微图像中整幅全是黑色背景的图像得到剩余图像,并标注出所述剩余图像中的阳性区域得到标注图像;依据所述标注图像的信息对所述剩余图像和所述标注图像进行切片,生成所需的训练数据集;以残差网络和空洞卷积模块为网络的主体骨架构建深度卷积神经网络模型,读取所述训练数据集训练生成用于分割检测的目标模型,以使用所述目标模型对待检测真菌显微图像进行识别得到所述待检测真菌显微图像的真菌致病相的分割结果。通过本发明能够将致病相的菌丝结构从图像中分割并精准定位。

    一种多路扫描与探测的线共聚焦成像装置

    公开(公告)号:CN108519329A

    公开(公告)日:2018-09-11

    申请号:CN201810252673.4

    申请日:2018-03-26

    IPC分类号: G01N21/01

    摘要: 本发明公开了一种多路扫描与探测的线共聚焦成像装置,包括:激发光模块、扫描成像模块以及探测模块;激发光模块用于提供由两束激光束整形得到的两条相互分离的线光斑,激光束的倾斜角和发散角均可调节;扫描成像模块用于将两条线光斑聚焦到不同的成像位置,从而产生两束成像光束,并实现三维扫描成像;探测模块用于实现两路成像光束的分离和探测;通过精细调节激发光模块中两路光束的倾斜角和发散角,可以实现双焦面同时扫描成像或者单物镜视场同一焦面双线同时扫描成像。本发明能够有效提高成像速度,同时便于系统调节。